摘要
背景肺动脉高压(PAH)和肺静脉闭塞性疾病/肺毛细血管瘤病(PVOD/PCH)的遗传形式因肺组织病理病变、临床和临床旁表现、其相关基因和传播方式而异。自鉴定以来BMPR2在多环芳烃影响的家族中,发现了其他几种基因的突变。这些新基因的突变情况尚不清楚。
方法我们建立了基于下一代测序的靶向测序基因面板,允许同时分析PAH和PVOD/PCH的已知基因.对263例PAH和PVOD/PCH患者(成人和儿科病例)进行前瞻性遗传分析。
结果在散发型PAH患者(n=180)的19.5%、家族性PAH患者的54.5%和PVOD/PCH患者的13.3%中发现了致病性突变。BMPR2是最频繁突变的基因,其次是TBX4在儿科和成人多环芳烃中BMP9在1.2%的成人PAH病例中发现了突变。EIF2AK4双等位基因突变仅限于PVOD/PCH。中还发现了截断突变和预测的功能丧失变异BMP102例严重感染散发型多环芳烃的女性患者。
结论我们的研究结果证实了基因突变的存在BMPR2在遗传性多环芳烃中,强调的作用TBX4而且BMP9,并指定BMP10作为新的多环芳烃基因。
摘要
基因面板测序揭示了成人和儿童肺动脉高压的遗传结构,强调了BMPR2,EIF2AK4,BMP9而且TBX4突变,并建议BMP10作为疾病的新基因http://ow.ly/Oxes30mXnrI
简介
肺动脉高压(PAH)是一种罕见而严重的小肺动脉疾病,其特征是肺血管阻力逐渐增加,导致右心室衰竭,在不进行治疗或移植的情况下最终死亡。当没有证实已知的危险因素或相关疾病时,可作出特发性多环芳烃(IPAH)诊断[1].除特发性外,遗传性多环芳烃病例(遗传性多环芳烃(hah))约占30%,这一类别包括有或无已确认突变的家族型(家族性多环芳烃(fah))和携带突变的散发型[1].HPAH是一种遗传异质性疾病,是一种不完全外显的常染色体显性疾病。参与HPAH突变的主要基因是BMPR2(骨形态发生蛋白受体2型),是一种编码BMP信号通路2型受体的基因[2].BMPR280%的fah >和~ 15%的散发性多环芳烃发生突变[3.,4].BMPR2基因突变携带者在男性中发病的比例为14%,在女性中发病的比例为42%,尽管这一比例在家庭之间差异很大[5].同一途径的其他基因发生突变,ACVRL1(激活素A受体样1型),在极少数情况下英格(endoglin),可能引起与遗传性出血性毛细血管扩张症(HHT)相关的多环芳烃[6,7].突变的SMAD9编码转录因子Smad8, Smad8是BMP信号的重要下游中介BMP9(别名GDF2(生长分化因子2)),编码的配体ACVRL1,在多环芳烃中有描述[8,9].与BMP信号通路无关的其他基因突变也已被确认。突变KCNK3(钾通道双孔结构域亚家族K成员3;别名TASK1(twik相关酸敏K+通道1))编码电压敏感的钾通道,已在几个多环芳烃家族中被发现,并证实了所识别的错义突变的功能后果在体外[10].一个纯合子KCNK3功能丧失(LOF)变体随后在一个近亲家庭的严重多环芳烃的儿科病例中被描述[11].只有三个突变CAV1编码小洞穴蛋白-1的基因目前已被确认:一个基因属于多例多环芳烃的大家族,另一个基因属于多环芳烃的大家族新创一个幼儿和第三个突变与先天性全身性脂肪营养不良有关[12,13].
TBX4(T-box 4)突变已经在多环芳烃的起源被确认,通过重叠染色体缺失包括TBX4诱发儿童多环芳烃,以及骨骼异常,这促使研究人员寻找TBX4其他儿童多环芳烃的基因[14].TBX4杂合子失活突变导致小髌骨综合征(也称为髋臼髌综合征),该综合征与髌骨、骨盆、足和股骨不同程度的骨异常有关。此前有报道称,携带aTBX4儿童病例的突变率较高,高于成人病例,这表明该基因的突变对儿童有特殊影响[15,16].
肺静脉闭塞性疾病(PVOD)和肺毛细血管瘤病(PCH)均以小静脉和间隔静脉弥漫性重塑为特征,其内膜纤维化伴有斑块状毛细血管增生和不同程度的动脉病变。双等位基因突变EIF2AK4(真核翻译起始因子2α激酶4)已被证明与作为隐性疾病传播的PVOD和PCH的遗传形式有关[17,18].遗传形式的PVOD和PCH(在这里进一步称为PVOD)具有相同的临床表现,预后较差,即使组织学肺病变可能不同(主要是由于毛细血管增殖的重要性),也被认为是相同的实体。
本研究的目的是描述可以在前瞻性收集的零星或fah或PVOD患者中发现的突变,并推断每个已知的负责基因在成人和儿童形式的肺动脉高压中的各自位置。我们报告了一大批PAH或PVOD患者的基因型和表型特征,通过基因板测序检测单核苷酸变异(SNVs)和拷贝数变异(CNVs)。
患者和方法
病人
这项研究包括法国肺动脉高压调查中心(包括法国肺动脉高压转诊中心(Hôpital Bicêtre, Université Paris-Sud, Le Kremlin-Bicêtre, France)和相关专家中心的263名患者。所有病例的临床诊断均为散发或fah,药物和毒素诱导的PAH,或由专家中心确定的散发PVOD。根据先前描述的协议,通过对所有纳入研究的患者右心导管插管过程中的血流动力学测量来确定毛细血管前肺动脉高压的诊断[19].在临床、生物学和遗传学调查排除了所有已知原因后,零星多环芳烃患者被进一步称为IPAH [20.].当家庭中至少有两例病例报告至第三代亲属时,病例被认为是pah。经医院调查诊断为相关多环芳烃的患者(特别是结缔组织疾病和艾滋病毒感染)不包括在内。
诊断年龄<18岁定义为儿科病例。
确诊或极有可能的PVOD的诊断是根据先前描述的标准建立的[17,21]并且,由于纳入期重叠,一些PVOD患者在之前的一篇文章中被纳入[22].本研究中所有PVOD患者均为散发病例。
PAH诊断的临床特征存储在法国肺动脉高压登记处。该登记处是根据法国生物伦理法(国家信息委员会和Libertés)设立的,患者同意纳入该登记处[23].其中90%以上的患者为欧洲白种人后裔。本研究纳入的所有患者均接受了遗传咨询并签署了书面知情同意书。
本研究纳入的所有病例均为2014 - 2017年前瞻性收集的肺动脉高压发病指数病例,除8例既往阴性患者外,在纳入期间诊断时进行DNA测序分析BMPR2而且ACVRL1被提及的新创基因面板分析。
捕捉设计
我们针对所有外显子设计了一个定制的基因面板,包括侧翼内含子序列的50 bp和每个感兴趣基因的上下游1kb区域。该小组包括9个用于肺动脉高压分子诊断的基因分析(BMPR2,TBX4,EIF2AK4,CAV1,KCNK3,SMAD9,ACVRL1,英格而且BMP9).的BMP10基因,BMP9Paralogue也包含在捕获设计中。这一下一代测序(NGS)组还包含了与肺动脉高压和其他遗传性血管疾病(HHT,毛细血管和动静脉畸形)相关的额外基因,以临床诊断和研究为目标,占总靶序列的79%。
目标捕获测序法
根据KAPA样品制备协议(KAPA Biosystems, Wilmington, MA, USA)使用1 μg基因组DNA制备文库。经过适当的质量控制后,将库汇集(12个样本池),并按照制造商协议使用SeqCap EZ选择库(Roche/NimbleGen, Madison, WI, USA)进行捕获。使用MiSeq系统(Illumina, San Diego, CA, USA)对捕获的两个库(24个样本)进行测序,生成2×150 bp对端读取。
数据分析
变异的质量控制、加工和检测是由GenoDiag (Paris, France)提供的一项服务。简单地说,FASTQ序列文件用BWA 7.12版本(http://bio-bwa.sourceforge.net),并使用SAMtools 1.1版本转换为BAM文件(www.htslib.org).SNV和插入/删除(indel)调用在GATK 3.5版本(https://software.broadinstitute.org/gatk).用基因diag专有脚本检测cnv。检测是基于每个外显子的覆盖率。根据样本之间的变化,应用归一化来去除覆盖率偏差。然后用归一化覆盖率计算z分数。另外计算了两个参数,即。覆盖分散度和覆盖率,用来衡量测序质量和缺失或重复的重要性。这三个值用于过滤假阳性结果并设置事件置信度。每个基必须被至少40个读取覆盖才能进行验证。该方法在23个主要基因上含有SNVs或CNVs的样本上得到验证(BMPR2,EIF2AK4而且ACVRL1).
对误义变体的假定功能影响进行了评估在网上在基因组聚合数据库gnomAD中使用SIFT, polyphen2, Combined Annotation Dependent Depletion (CADD) Phred评分和等位基因频率[24- - - - - -26].使用Alamut 2.7.1版本查询所有数据库和软件(www.interactive-biosoftware.com/alamut-visual),但CADD Phred评分是通过ensemble bl网站上的变异效应预测工具获得的(http://grch37.ensembl.org/Homo_sapiens/Tools/VEP?db=core).根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)的标准对每种变体进行分类[27].通过点突变的Sanger测序和可用的多重连接依赖探针扩增(MLPA) (MRC-Holland, Amsterdam, Netherlands)或大规模重排列的定量PCR (qPCR)分析确认任何潜在致病变异。
统计分析
数据以平均数和标准差表示。由于数据不服从正态分布,在适当的情况下使用非参数Mann-Whitney检验或Fisher精确分析进行比较,使用XLStat 2014 (www.xlstat.com).显著性阈值(p<0.05)通过Benjamini-Hochberg校正进行多次检验。
为了评价的关联BMP10与多环芳烃的变异,我们比较的频率BMP10polyfen -2预测的可能具有破坏性影响的错义变异,SIFT预测的有害影响和CADD评分>20 (n=32), gnomAD报告的LOF变异(n=3)的频率为BMP10在我们的队列(n=2)中检测到相似特征的变异。统计学比较采用卡方分析。
结果
序列分析和质量控制
设计了用于富集目标DNA的捕获板,该捕获板由150 071 bp组成,覆盖289个目标捕获区域。我们的设计和测序方案通过筛选一组23例患者进行了验证,这些患者之前都进行了桑格测序和MLPA分析。所有之前发现的突变(n=16) (SNVs和inds)和CNVs (n=4)均通过NGS分析检测到。相反,3例患者未检测到突变。
本研究共分析了29个不同的测序运行。均值±sdQ30质量评分为91.5±3.8%。所有分析样本的平均覆盖率为1106±353次。在感兴趣区域内定位的reads占95.6±3.4%,在感兴趣区域外定位的reads占2.6±2.2%,未定位到人类基因组的reads占1.8±1.6%。
检测的肺动脉高压基因突变
经过谱系分析和临床检查,180例患者最初被分类为散发型多环芳烃,11例为fah(仅包括指标病例),13例为药物和毒素诱导的多环芳烃,59例为散发型PVOD (图1).在263例分析的患者中,有49例发现了突变。双等位基因的鉴定EIF2AK4一名最初疑似PAH病例的突变导致我们将该患者重新归类为PVOD。因此,在散发型PAH患者中发现了35个突变(占散发型PAH的19.5%),在fah患者中发现了6个突变(占PAH的54.5%),在PVOD患者中发现了8个突变(占PVOD的13.3%)(表1).
31BMPR2突变(25个散发PAH和6个fah), 5个TBX4突变(5个零星多环芳烃),2个ACVRL1(两个零星多环芳烃),两个BMP9(两个零星IPAH),一个SMAD9(1个散发的PAH)和8个双等位基因EIF2AK4发现了8个PVOD突变(表1).大部分的BMPR2突变是截断突变,即。中断基因功能的停止密码子(n=11)或索引(n=1) (补充表S1).发现了三种不同的错义突变:两种以前描述过,第三种(p.A373V)是新的。这种突变位于BMPR2的激酶结构域,改变了一个保守的残基,被预测是有害的在网上工具(参见数据分析)。根据ACMG标准[27],该突变被归类为可能的致病性。发现了三个剪接突变:两个影响一致剪接位点,一个位于内含子7内的c.968-12位置,预计会影响后续的剪接在网上分析。利用从突变载体的循环血细胞中提取的RNA进行逆转录PCR实验,证实了mRNA的拼接存在缺陷,导致成熟mRNA中加入内含子序列并产生移码(补充图S1).
剩下的6个BMPR2突变是由NGS检测到并经MLPA证实的CNVs。另外两个CNVs也被检测到:一个在SMAD9还有一个TBX4.qPCR结果均为阳性。所有EIF2AK4鉴定出的突变是双等位的:5个处于纯合子状态,3个为复合杂合子。
只发现截断突变TBX4而且BMP9(停止密码子n=2, indel n=4和CNV n=1),而之前描述的两个错义突变在ACVRL1.HHT症状出现在成人病例ACVRL1突变携带者,而儿科病例在诊断时没有HHT的迹象,在实验室被称为散发性多环芳烃。
的BMP10基因也被包括在基因面板中,之后的描述BMP9多环芳烃突变和由于两个基因之间的密切相似性(65%的序列一致性在蛋白质水平)。在一名年轻女性患者中发现了位于成熟BMP10肽编码区上游的截断突变(c.370C>T, p.Arg124*),该患者在11岁时被诊断为散发PAH,并发生严重进化(表2患者1)。该年轻患者有一个小的房间隔缺损和一个小的限制性室间隔缺损,在2岁时自发闭合。一个预测BMP10LOF突变(c.1057C>T, p.Arg353Cys)在另一名28岁诊断为散发PAH的患者中被发现,该患者在严重的临床条件下于35岁移植(表2Arginine 353位于BMP10的生长因子片段中,在种与整体之间具有高度保守性(补充表S2)在网上对该变异的分析与有害作用一致(表4).计算LOF不耐受的概率BMP10并发现为0.72,这个值接近不耐受阈值0.9,在该阈值处LOF突变可能是有害的,而LOF突变的不耐受阈值为0.09BMP9[24].根据联合生物信息预测工具(见数据分析),在可能有害的变异的频率和截断突变之间发现了高度显著的差异BMP10在我们的肺动脉高压队列中LOF的频率(246000个等位基因中的40个等位基因上的35个不同的变体)与536个检测等位基因中有两个LOF变异;p < 0.0001)。
患者在诊断时呈现不同的年龄,从新生儿到老年人(>80岁)。为了准确了解在成人和儿童病例中发现的突变的基因图谱,对18岁以下和18岁以上的患者进行了单独的分析(表3).对35例儿童和168例成人PAH病例进行了分析。成人和儿童PAH病例的突变率无显著差异(分别为19%和26%)。BMPR2突变在两个年龄组中都是最常见的(在成人和儿童组中分别占已确认突变的75%和77%)。TBX4在成人和儿童病例中检测到的突变频率相似(每组分别占已识别突变的12.5%和11%)。
在一个病例临床上称为新生儿多环芳烃,双等位基因突变EIF2AK4,导致被重新归类为未识别的PVOD。相比之下,在最初诊断为PVOD的其他三个儿科病例中没有发现突变。在成人PVOD患者中,只有双等位基因EIF2AK4发现了突变(12.5%的病例检测呈阳性)。
确定了意义不确定的变体
根据ACMG标准[27],在研究的基因中发现了14个不确定显著性(VUS)变异。在网上VUS的分析在表4.未发现致病性突变KCNK3而且CAV1但在这些基因中发现了两种VUS。的误义变体KCNK3被发现位于该通道的细胞外区域,这个位置与先前在PAH中涉及该基因的第一项研究中显示的改变该通道功能的错义突变相似。在框架内的一个氨基酸缺失被鉴定CAV1也应该被认为是VUS。
两个BMPR2发现了gnomAD数据库中未描述的启动子变体。两个错义EIF2AK4在同一个体中发现了变异,但无法确定它们在两个不同等位基因上的位置。
诊断时的临床状况
突变携带者与非携带者在诊断时的临床表现比较见表5治疗成人多环芳烃、儿童多环芳烃及成人多环芳烃中毒。在成人多环芳烃和PVOD中,突变携带者的诊断年龄明显低于非携带者,但在儿童多环芳烃中却不如此。在成人多环芳烃中观察到的性别分布(女性多2- 3倍)与先前在分析的不同队列中描述的相似[5,28].在多环芳烃儿科病例中也观察到类似的趋势。非携带者PVOD的性别分布显示男性无显著优势,与多环芳烃形成对比(p<0.0001;表3),而在EIF2AK4变异携带者(表3而且5).
即使成人PAH的平均肺动脉压达到统计学意义,但突变携带者的血流动力学参数往往更差。
在成人和儿童PAH病例中,急性血管扩张剂反应者的比例往往高于非携带者,即使没有达到统计学显著性(表5).
讨论
大规模并行测序(即。NGS)已经彻底改变了遗传性疾病的分子遗传学,使新的致病基因得以识别,并使临床分子诊断效率大幅提高[29].针对一组已识别的疾病基因的靶向NGS是一种有效的方法,可以对潜在的致病基因进行广泛的、经济上可接受的调查。
在这一前瞻性的事件病例研究中,我们使用NGS面板方法对参考实验室转诊的PAH或PVOD患者进行研究。基因组包括通过以前的出版物建立的基因和基于生理功能和以前的数据的研究基因。使用这种NGS靶向捕获方法,可以通过单一技术检测不同类型的突变(snv、cnv和indels),从而节省成本和时间。
BMPR2是成人(家族性和散发性)多环芳烃的主要基因,就像儿科形式的多环芳烃一样。在fah病例中,只有突变BMPR2被发现,可能是因为它的主要频率,但更具体的原因可能涉及与突变基因相关的外显和临床进化。这些结果与先前发表的结果一致[30.,31].
在本研究中,TBX4突变是第二大最常见的突变之后发现BMPR2在成人和儿童多环芳烃病例中。我们先前观察到经常发生TBX4儿童多环芳烃的突变[15],最近另一项基因研究证实了这一结果[16].的显著频率TBX4本研究中在成人病例中发现的突变,与之前报道的结果形成对比[16],可能是由于随机差异以及患者收集模式(流行和存档患者)的差异与事故情况下)。
BMP信号通路的其他基因突变被发现(BMP9而且SMAD9),这使得这些基因在多环芳烃中的作用得以证实,因为文献中只描述了很少的病例。的确,最初的描述BMP9突变与一种特殊形式的HHT相关,随后描述了一例与双等位基因LOF相关的严重PAH [32,33].罕见的杂合的BMP9最近通过全基因组测序在一大批患者中发现了突变[9].在我们的研究中,BMP9是成人多环芳烃病例中第三个最频繁突变的基因(1.2%的多环芳烃病例,6.3%的已识别突变),这表明该基因与多环芳烃有显著相关性。杂合子小鼠遗传模型BMPR2LOF显示BMP9输注可改善缺氧诱导的多环芳烃,这一结果进一步支持该基因参与多环芳烃,尽管是间接的[34].在研究努力的设置中,我们进行了调查BMP10的近义词BMP9它编码ALK1的激活配体(ACVRL1),并被证明在血管生成的实验模型中发挥与BMP9相同的作用,因为它可以替代BMP9BMP9敲除小鼠[35,36].最近也有研究表明,BMP9-BMP10异质二聚体在人血浆中循环,是主要的生物受体激活复合体,尽管这种异质二聚体的附加功能尚未确定[37].我们找到了一个BMP10杂合子截断突变和一在网上预测了两例年轻女性严重多环芳烃患者的LOF错义变异。2例患者中有1例出现小的心房左向右分流和小的高度限制性室间隔缺损,无肺溢流,在2岁前自动闭合,而PAH在11岁时诊断。该临床表现不允许根据2013年与先天性心脏病相关的多环芳烃分类将该病例归类为巧合病例或术后病例[1,但提出了一个问题的关系BMP10杂合子LOF,心脏发育和多环芳烃,自Bmp10-缺陷小鼠胚胎很早就死亡,在胚胎9.5天至10.5天之间,心脏和血管发育有重大缺陷[38,39].识别两个LOF变体BMP10由于该基因的生理作用,其LOF不耐受的概率评分,以及患者和非选择人群之间LOF变异频率的高度显著差异,该基因在PAH中高度提示其责任。BMP10-相关的多环芳烃易感性似乎与不完全外显的常染色体显性遗传相容,但也可能与其他因素一起作为易感因素。的确,有些误解BMP10根据生物信息预测工具,可能致病的变异在gnomAD数据库中以极低的频率发现,与其他PAH基因一样。进一步的研究将允许的作用BMP10待定义的突变。无致病性突变CAV1在本研究中发现,与之前的报道一致,并针对大系列患者[9,30.,总的来说,这些结果表明该基因在多环芳烃易感性中的参与非常有限。
双等位基因的比率EIF2AK4在成人散发PVOD病例中发现的LOF突变(12.5%)与我们之前发表的散发病例结果一致[22],但低于已报道的系列[39].这种差异可能是由于有限的病例数量和患者收集的特异性所导致的随机变化。唯一的双等位基因EIF2AK4在一个新生儿病例中发现的PVOD的儿科形式的突变最初被转诊为多环芳烃分子诊断,提示早期心肺衰竭[22].这个案例强调了…的重要性EIF2AK4在所有假定病例中进行检测以确定诊断,因为临床图像可能具有误导性,而能够最好地区分多环芳烃和PVOD(高分辨率计算机断层扫描和肺对一氧化碳的扩散能力)的调查可能没有明确的区分或遗漏,甚至是禁忌(肺活检)[22,30.,31].EIF2AK4通过临床基因检测的突变识别对于遗传性PVOD的高外显率和疾病严重程度、对经批准的PAH治疗反应的肺水肿风险特别重要,因为它允许遗传咨询和适应的随访,包括及时转诊进行肺移植。EIF2AK4突变的解释通常是直接的,但在一种情况下,有两种误解EIF2AK4在一名PVOD患者中发现了突变,两者都被考虑在内在网上为良性,在gnomAD数据库中出现的频率很高。可以推测,携带两种误义变体,如果定位在反式,可能导致这种疾病,但这一假设需要进一步调查。
在进行遗传分析的各种患者类别中,发病年龄和性别差异是遗传类型(其中外显率是决定这些参数的主要因素)和非遗传类型(环境因素占主导地位)混合的结果。在PAH中观察到的性别比例与之前在不同队列中发现的值一致,包括突变携带者和非携带者[5].在成人中EIF2AK4突变携带者,性别比例分析受受试者数量的限制,但似乎是平衡的。的确,有很强的外显力EIF2AK4两性的突变可能解释了平衡的性别比例,正如常染色体隐性遗传病所预期的那样。
如前所述,突变携带者多环芳烃组的诊断年龄也较年轻BMPR2突变携带者[28].在成人PVOD组中,突变携带者和非携带者在发病年龄上存在很大差异,我们小组已经报道了这一观察结果[17,22].在非遗传性PVOD中已有明确的环境因素的文献记录,这可能解释了遗传型和其他型之间在发病年龄上的巨大差异(34.4与61.2年;p < 0.0001)。
我们的数据报告了迄今为止所有描述基因的序列分析,仍然有很高比例的病例未得到解决,特别是儿科和家庭病例。识别和解释已知责任基因(包括非编码区域)的所有变体的功能影响仍然是一个重大的现实挑战,需要进一步的努力和知识,但这将阐明大量的案例[29].例如,在我们的研究中,我们发现了一个位于非一致剪接位点(内含子位置−12)的变体,并通过cDNA分析证明它改变了mRNA的剪接。我们还发现了两例VUSBMPR2启动子和功能的研究是必要的,以评估这些变异对基因调控的病理影响。
一些患者的功能数据参数的缺失限制了本研究在基因型-表型关系方面的影响,尽管这方面超出了本研究的范围。
通过对大量不相关病例或多例肺动脉高压家庭的全外显子组测序和全基因组测序,可以发现附加基因的突变。事实上,最近通过全基因组测序方法在一系列多环芳烃病例中发现了以前未描述的基因的罕见变异[9并通过全外显子组测序来寻找新创儿科病例的突变[16].这些新发现的基因可以很容易地添加到靶板中进行进一步的评估和临床分子诊断。由于经济和技术方面的原因,靶向捕获面板方法是目前最有效的临床分子诊断的第一步诊断步骤。
一个主要的挑战将是阐明各种基因倾向于PAH或PVOD的发展是通过一个共同的机制,就像属于BMP信号通路的基因所提出的,还是通过不同的机制。例如,在胚胎发生过程中,BMP通路对于中胚层和间充质细胞的发育非常重要,TBX4在发育过程中驱动间充质祖细胞入侵肺也是如此[40].BMP4也被证明具有诱导作用TBX4培养人肺成纤维细胞的表达[41].EIF2AK4和BMP信号通路之间的调控连接最近在果蝇,但随后观察到BMP信号激活增加Eif2ak4果蝇同源物失活与BMPR2缺乏的预期效果不符[42].
我们对已知肺动脉高压基因数据的全面分析似乎证实了之前描述的所有主要基因的参与,如果不仅是LOF突变,而且考虑到各种基因上已经发现的错义变体。事实上,将多环芳烃的致病作用归咎于杂合突变是毫无疑问的主要基因如BMPR2而且TBX4但对于其他基因来说可能更困难,因为关于多环芳烃的数据较少。我们的数据的一个兴趣是刺激分析BMP9而且BMP10多环芳烃的临床分子诊断基因,允许来自多个中心或大型多中心研究的结果在未来共享。
补充材料
确认
我们感谢Anne Leroy和Marie-Christine Waill (Département de Génétique, Hôpital Pitié-Salpêtrière, AP-HP,法国巴黎)提供的专家技术援助。我们感谢法国肺动脉高压网络的患者、他们的家属和医疗保健提供者同意合作,以及法国HTAP患者协会。
脚注
本文的补充资料可从www.qdcxjkg.com
利益冲突:M. Eyries报告了罗氏法国诊断公司在进行研究期间的个人费用。
利益冲突:D. Montani报告了来自Actelion、GSK、MSD和辉瑞的个人费用,在提交的作品之外。
利益冲突:S. Nadaud没有什么可透露的。
利益冲突:B. Girerd没有什么可透露的。
利益冲突:M. Levy没有什么要透露的。
利益冲突:A. Bourdin报告了来自GSK的赠款、演讲和非财政支持的个人费用、来自阿斯利康和勃林格殷格翰的演讲和顾问委员会工作的赠款、个人费用以及来自阿斯利康和勃林格殷格翰的非财政支持、演讲和顾问委员会工作的个人费用以及来自诺华的非财政支持、来自默沙东的赠款、来自Actelion的演讲赠款和个人费用,以及来自奇西制药的演讲和非财政支持的个人费用,这些都在提交的工作之外。
利益冲突:R. Trésorier没有什么要透露的。
利益冲突:A. Chaouat没有什么可透露的。
利益冲突:V. Cottin报告了Actelion和罗氏公司的咨询、讲座和出席医学会议的个人费用、Boehringer Ingelheim公司的教育演讲、咨询、讲座和出席医学会议的个人费用、拜耳公司的个人咨询费、吉利德公司的裁决委员会工作的个人费用、默沙东公司的咨询和出席医学会议的个人费用、诺华公司和赛诺菲公司的咨询和讲座的个人费用、来自勃林格殷格翰和罗氏的机构拨款,来自Promedior和Celgene的数据和安全监测委员会工作的个人费用,以及来自加拉帕戈斯群岛的咨询和数据和安全监测委员会工作的个人费用。
利益冲突:C. Sanfiorenzo没有什么可透露的。
利益冲突:G. Prevot没有什么可透露的。
利益冲突:雷诺-高贝尔先生没有什么可透露的。
利益冲突:C.德罗默没有什么可透露的。
利益冲突:A. Houeijeh没有什么可透露的。
利益冲突:K. Nguyen没什么可透露的。
利益冲突:F. Coulet没有什么可透露的。
利益冲突:D. Bonnet报告了在提交的工作之外,为Actelion制药公司、拜耳医疗保健公司和诺华公司的顾问委员会工作支付的个人费用。
利益冲突:M. Humbert报告了Actelion、拜耳、GSK、强生、默克和联合治疗公司在提交作品之外的个人费用。
利益冲突:F. Soubrier没有什么可透露的。
支持声明:该作品由Legs Poix (Universités de Paris总理府)支持。本文的资助信息已存入Crossref基金管理人登记处.
- 收到了2018年4月25日。
- 接受2018年11月23日。
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