摘要
基本原理非结核分枝杆菌(NTM)是一种环境分枝杆菌,可引起慢性进行性肺部疾病。虽然流行病学资料显示潜在的遗传易感性,但其性质仍不清楚。
目标我们旨在识别主机敏感性基因座分枝杆菌复合体(MAC)是最常见的NTM病原体。
方法这种基因组 - 范围的协会研究(GWAS)是在日本肺癌和健康对照的日本患者中进行的,然后在另一种日本队列中进行候选单核苷酸多态性(SNP)的基因分型。韩国和欧洲血统核查,我们进行了SNP基因分型。
结果的GWAS发现组包括475肺MAC病例和417点的控制。的591肺MAC病例和718个同时控制GWAS和复制分析显示最强的关联与16p21染色体,特别是与rs109592(P = 1.64×10−13, OR 0.54),位于钙调磷酸酶样EF-hand蛋白2 (CHP2).表达量性状位点分析显示CHP2与肺组织表达有关。CHP2在肺MAC病的肺组织中表达。该SNP与结节性支气管扩张亚型相关。此外,该SNP与韩国患者的疾病显著相关(p=2.18×10−12,OR 0.54)和欧洲(P = 5.12×10−03,OR 0.63)的祖先。
结论我们确定rs109592的CHP2基因座作为肺MAC疾病的易感标志物。
摘要
肺疾病MAC的第一GWAS在日本,韩国和欧洲的病人。单核苷酸多态性在CHP2区域进行与疾病风险有关。CHP2可能在宿主易感性的重要作用,肺部疾病MAC。https://bit.ly/39iCIio
脚注
这篇文章有提供补充材料www.qdcxjkg.com.
数据和材料的可获得性:所有原始数据可由通信作者提供。
作者投稿:H. Namkoong,Y.大前,K.德永及N.长谷川设计研究。H. Namkoong,Y.大前,T.朝仓,Y.川井,K.柄本,A.J.Oler,M.吉田,E.P.Szymanski的,J.滨本,H.J.咦,H-H。韩元,K. Kosaki,H. Tettelin,H.松原,K.德永和N.长谷川分析数据。H. Namkoong,T.朝仓,M.石井,S.铃木,K.森本,S.松田,K.八木,I. Hase的,T.西村,Y.佐佐木T.麻美,T.盐见,H.松原,H. Shimada, B.W. Jhun, S-Y. Kim, M. Ato, T. Betsuyaku, K. Fukunaga, A. Kurashima, H. Yanai, S. Mahasirimongkol, K.N. Olivier, Y. Hoshino, W-J. Koh, S.M. Holland and N. Hasegawa recruited participants and collected clinical data. All authors contributed to study conduct and approved the final manuscript.
利益冲突:H. Namkoong报告JSP(JSPS Kakenhi Grant编号15H06590),asmed(2019年美国 - 日本协同提案28863)和核心/ CENT intalural结核病研究倡议(来自CAN 8020315的FY19启动支持),在此期间进行该研究。
利益冲突:Y.大前研究进行期间报告从JSPS KAKENHI(18K15041),补助金。
利益冲突:T. Asakura报告了来自jsp的授权,在提交的工作之外。
兴趣冲突:M.Ishii报告来自JSPS Kakenhi(18H02821,18K19566)的授予,外面提交的工作。
利益冲突:S. Suzuki报告了JSP的赠款,外部的工作。
利益冲突:K. Morimoto报告了阿米德(2019年美日合作提案28863)在进行研究期间的拨款;来自INSMED的个人咨询费用,在提交的工作之外。
利益冲突:河合Y.有没有透露。
利益冲突:K. Emoto没有什么可披露的。
利益冲突:A.J.Oler有没有透露。
利益冲突:E.P.西曼斯基没什么可透露的。
利益冲突:M. Yoshida报告了在研究进行期间来自JSPS(青年科学家资助(B), JSPS KAKENHI资助号17K16066)的资助。
利益冲突:S. Matsuda没有什么可透露的。
利益冲突:K. Yagi没有什么可透露的。
利益冲突:I. Hase没有什么可披露的。
利益冲突:T. Nishimura报告了来自JSPS KAKENHI (16K09942)的拨款,在提交的工作之外。
兴趣冲突:Y.Sasaki报告了JSPS(JSPS Kakenhi Grant编号15H06590)的赠款,在该研究期间。
利益冲突:麻美没有什么可透露的。
利益冲突:T. Shiomi没有什么可透露的。
利益冲突:H. Matsubara没什么可透露的。
利益冲突:H. Shimada没有什么可披露的。
利益冲突:J. Hamamoto报告了来自JSPS KAKENHI (19K08610)的拨款,在提交的工作之外。
利益冲突:B.W. Jhun报告了阿米德(2019年美日合作提案28863)在研究进行期间的拨款。
利益冲突:S-Y。金没有什么可以披露的。
利益冲突:H.J. Huh没有什么可披露的。
利益冲突:H-H。韩元没有透露。
兴趣冲突:在研究中,M. Ato报告日本医学研发机构的赠款。
利益冲突:K. Kosaki报道来自日本署资助医学研究和开发(AMED),外提交作品。
利益冲突:T. Betsuyaku报告了JSPS KAKENHI和日本医学研究与开发机构(AMED)的资助,在提交的工作之外。
利益冲突:K.福永报告从JSPS KAKENHI和日本的机构医学研究与发展(AMED),补助提交作品之外。
利益冲突:A. Kurashima报告了在进行研究期间,Insmed的个人咨询费用。
利益冲突:H. Tettelin报告了NIAID在研究期间的拨款(合同号为HHSN272200900009CJSPS)。
利益冲突:H. Yanai没有什么可披露的。
利益冲突:S. Mahasirimongkol没有什么可披露的。
利益冲突:K.N.奥利维尔报告了来自AIT治疗公司的非经济支持,来自Insmed的非经济支持,在提交工作之外。
利益冲突:Y. Hoshino报告了日本的医学研发机构/日本国际合作机构(amed)的赠款(JP18FK0108043和JP18FK0108075)。
利益冲突:W-JKoh在研究过程中报告了韩国国家研究基金会的资助(批准号为NRF-2018R1A2A1A05018309)。
利益冲突:S.M.荷兰无所事事。
兴趣冲突:K.Tokunaga在研究期间报道了日本医学研发局的赠款(研究JP17KM0405205205205205205205202)的赠款。
利益冲突:N. Hasegawa报告了日本医学研究和开发机构(AMED)在进行研究期间的拨款;JSPS KAKENHI的资助,INSMED的个人咨询费用,提交的工作之外。
支持声明:该作品被日本机构医学研究与发展(AMED)(项目编号JP17FK0108116H0401,JP17KM0405205H0002,JP18FK0108043,JP18FK0108075,18km0405205h0003,19km0405205h9904,19kk0205012h0004,美日合作医疗科学计划合作奖2019),庆应义塾义塾学术支持发展基金,资助,在援助的研究活动启动(JSPS KAKENHI)(授权号15H06590),赠款的援助青年科学家(B)(JSPS KAKENHI)(授权号15K19039,17K16066),格兰特 - 在-aid科研(B)(授权号19H03704,15H05271,24406010),以及由韩国政府(MSIT)(批准号NRF-2018R1A2A1A05018309)资助的韩国国家研究基金会(NRF)。这项工作部分由联邦资金从国家过敏和传染病研究所,美国国立卫生研究院,卫生署和人类服务研究所基因组科学,根据合同号HHSN272200900009CJSPS支持。这项工作是由NIAID / CBER院内结核病研究计划和过敏和传染病国家研究所和国家心脏,肺和血液研究所,美国国立卫生研究院的校内方案的支持。本文资金的信息已交存CrossRef Resder注册表.
- 已收到2019年11月25日。
- 接受2020年12月30日。
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