抽象
背景原发性睫状体缺陷(PCD)是由大约50个纤毛相关基因突变引起的异质遗传障碍。PCD基因型 - 表型关系主要来自小型案例系列,因为研究关系的现有统计方法对罕见疾病不合适。
方法我们应用拓扑数据分析(TDA)方法来研究PCD的基因型-表型关系。来自独立训练和验证队列的数据包括396个携带PCD致病变异基因的遗传定义个体。为了建立TDA模型,纳入了12个临床和诊断变量。tda驱动的假设随后使用传统统计进行检验。
结果通过FEV测量的诊断中的疾病严重程度1z得分(i)在有CCDC39.与其他基因突变相比,(ii)有DNAH11突变;后者也报道了较少的新生儿呼吸窘迫。无新生儿呼吸窘迫的患者保存FEV较好1诊断。个人dnah5.突变具有表型多样性。纤毛超微结构和节拍模式缺陷与特定的致病基因群密切相关,证实这些测试可以用于支持遗传诊断。
结论这项大规模的多国研究将PCD表现为一种症状重叠、基因型变异的综合征。TDA模型证实了较小研究报告的基因型-表型关系(例如FEV.1更糟糕的是,CCDC39.突变),并确定了新的关系,包括FEV1保存DNAH11突变和严重程度的多样性dnah5.突变。
脚注
此手稿最近被接受了出版物欧洲呼吸杂志。它在汇款和排版的抄本之前在此处发布于其已接受的表单。在这些生产过程完成后,作者已批准所产生的证据,这篇文章将转向最新问题erj.线上。请打开或下载PDF以查看本文。
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- 收到2020年6月16日。
- 接受2020年12月24日。
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