摘要
背景哮喘是一种以持续气道炎症为特征的慢性肺部疾病。支气管上皮细胞(BECs)中miRNA介导的基因沉默已被报道,但腺苷脱氨酶对RNA (ADAR)介导的miRNA编辑在哮喘中的作用仍未被探索。
方法我们首先从142例成人哮喘病例和对照中鉴定出BECs中miRNAs中的腺苷到肌苷(a到i)编辑位点。测试了A-to-I编辑位点与哮喘严重程度和哮喘临床指标的相关性。配对RNA测序数据用于进行通路富集,并测试与未编辑和编辑miRNAs的生物信息学预测靶基因的关联。
结果在这些miRNAs中检测到的19个A-to-I编辑位点中,与对照组相比,病例中miR-200b-3p第5位的一个位点的编辑频率较低(p纠正=0.013),与中度(p纠正=0.029)和严重(p纠正= 3.9×10−4),但不温和(p纠正= 0.38),哮喘。生物信息学预测显示,编辑后的miR-200b-3p的232个靶基因富集于白介素-4和干扰素-γ信号通路,其中包括SOCS1(细胞因子信号1的抑制因子)基因。SOCS1在中度(p纠正=0.017)和严重(p纠正= 5.4×10−3)哮喘病例与对照组相比。此外,无论是miR-200b-3p编辑和SOCS1与支气管肺泡灌洗嗜酸性粒细胞水平相关。
结论中重度哮喘患者下气道细胞miR-200b-3p第5位A-to-I编辑减少可能导致miR-200b-3p过表达SOCS1以及受损的细胞因子信号。我们提出adar介导的编辑作为一种表观遗传机制,有助于成年期中重度哮喘的特征。
摘要
一项气道细胞内源性adar介导的miRNA编辑的全基因组研究揭示了miR-200b-3p的A-to- i编辑与靶基因之间的关联,SOCS1提示了一种新的治疗机制和治疗靶点https://bit.ly/2JWsifY
脚注
这篇文章有补充资料可从www.qdcxjkg.com
作者贡献:K.M. Magnaye, K.A. Naughton, J. Huffman, D.K. Hogarth, E.T. Naureckas, S.R. White和C. Ober收集样本,评估受试者并咨询研究设计。K.A.诺顿和J.霍夫曼处理和制备样品。K.M. Magnaye分析了数据。K.M. Magnaye和C. Ober负责研究设计并撰写了手稿。所有作者都阅读、评论并认可了手稿。
利益冲突:K.M.马格纳耶没有什么可透露的。
利益冲突:K.A.诺顿没有什么可透露的。
利益冲突:霍夫曼没有什么可透露的。
利益冲突:D.K. Hogarth报告Auris、Eolo、Noah Medical、LX-Medical、Preora、Broncus和Prothea-X的个人费用和其他(咨询),Ambu、强生、Oncocyte、Veracyte、Heritage Biologics、IDbyDNA、级别- ex、Medtronic、Neurotronic、Olympus、PulmonX、AstraZeneca、Biodesix、Genetech、Grifols、Takeda、CSL和GSK的个人费用、非金融支持和其他(咨询),来自Body Vision的其他(咨询),来自Eon、VIDA和Viomics的其他(咨询),来自Gravitas和Monogram Orthopedics的其他(股东),来自Med-Opsys的其他(所有者),来自Boston Scientific和Gala的资助和个人咨询费用,来自InhibRX的数据监测委员会工作的个人费用,在提交的工作之外。
利益冲突:E.T. Naureckas没有什么可透露的。
利益冲突:S.R.怀特没有什么可透露的。
利益冲突:C. Ober没有什么可透露的。
支持声明:本研究由U19 AI095230资助C. Ober和S.R. White。K.M. Magnaye由F31 HL143891赞助。本文的资助信息已存入交叉参考基金注册.
- 收到了2020年10月15日
- 接受2020年12月19日。
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