抽象
介绍淋巴管肌瘤病(LAM)发生或者与结节性硬化症复合物(TSC)或如散发性疾病(S-LAM)相关联。风险因素为S-LAM的发展是未知的。我们假设DNA序列变异外TSC2/TSC1可能与易感性S-LAM相关联,并且进行全基因组关联研究(GWAS)。
方法采用条件logistic回归方法,将426名S-LAM患者的5 426 936个单核苷酸多态性(SNPs)的基因分型和输入数据与来自COPDGene的852名女性的相似数据进行配对病例对照设计。在复制研究中,对196名非西班牙裔白人女性S-LAM受试者的基因型与三组不同的对照组进行了比较。同时进行RNA测序和免疫组化分析。
结果两个非编码基因型SNPs具有全基因组意义:rs4544201和rs2006950 (p=4.2×10)−8和6.1×10−9,分别位于染色体15q26.2上相同的35kb连锁失衡区。这种联系在一个独立的队列中得到了证实。NR2F2(核受体亚科2组F成员2),核受体和转录因子,是附近唯一的蛋白编码基因。NR2F2在一个腹部LAM肿瘤和四个肾脏血管平滑肌脂肪瘤(一种与LAM相关的肿瘤)中,RNA序列的表达高于所有癌症基因组图谱的表达。免疫组化在LAM和血管平滑肌脂肪瘤中均有较强的核表达。
结论染色体15q26.2的SNP与S-LAM相关联,并且染色质和表达数据表明,可以通过对作用发生这种关联NR2F2表达,这可能起着S-LAM发展具有重要作用。
抽象
GWAS确定了两个单核苷酸多态性的等位基因附近NR2F2即用零星的淋巴管肌瘤病有关。NR2F2是高表达在这两个LAM和LAM-肿瘤相关的转录因子,和NR2F2是一个新的LAM基因。http://ow.ly/87xx30oiVhZ
脚注
这篇文章有提供补充材料www.qdcxjkg.com
数据和代码可用性:主要的GWAS和复制数据将通过dbGaP (www.ncbi.nlm.nih.gov/gap)。
作者贡献:对作品构思和设计的贡献:S. Won, E.K. Silverman, G. Hunninghake和D.J. Kwiatkowski。对数据的获取、分析或解释的贡献:所有作者。为重要的智力内容起草或修改作品:所有作者。最终批准出版的版本:所有作者。同意对所有方面的工作负责:所有作者。
利益冲突:W. Kim还没有透露。
利益冲突:K. Giannikou有没有透露。
利益冲突:j.r.d Dreier没有什么要披露的。
利益冲突:S. Lee没有什么要披露的。
利益冲突:M.E. Tyburczy有没有透露。
利益冲突:E.K.西尔弗曼在研究期间报告了来自NIH的资助;诺华公司参加研讨会的酬金;以及来自葛兰素史克公司(GlaxoSmithKline)的资助和差旅支持。
利益冲突:电子Radzikowska有没有透露。
利益冲突:S. Wu没有什么要披露的。
利益冲突:C-L。吴没有什么要透露的。
利益冲突:E.P.Henske有没有透露。
利益冲突:G. Hunninghake从Genentech公司,勃林格殷格翰,格理集团和三菱化学,外提交的工作报告个人费用。
利益冲突:H. Carel没有什么要披露的。
利益冲突:A.罗马有没有透露。
利益冲突:文学硕士Pujana报告由罗氏制药提交的工作外津贴。
利益冲突:J.莫斯有没有透露。
利益冲突:赢球有没有透露。
利益冲突:D.J.Kwiatkowski有没有透露。
支持声明:本研究是林基金会的支持下,约翰•阿德勒TSC和林研究恩格斯基金和Bio-Synergy研究项目(nrf - 2017 m3a9c4065964)科技部,ICT和未来规划通过韩国国家研究基金会和校内研究项目,国家卫生研究院国家心脏,肺和血液研究所。本文的资助信息已存入交叉引用出资者注册。
- 收到2018年11月27日。
- 接受2019年3月19日。
- 本作品的内容不受版权保护。设计和品牌版权所有©2019
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