文摘
背景气道重构的分子基础在慢性阻塞性肺疾病(COPD)仍然知之甚少。我们确定了基因表达特征与胸部计算机断层扫描(CT)扫描气道措施理解分子途径与呼吸道疾病有关。
方法COPDGene 2396名受试者的研究中,我们调查了定量CT气道表型和血液转录组之间的关系来确定气道疾病特性基因和定义一个气道壁厚(AWT)基因组得分。多变量回归分析确定关联的AWT得分与临床表型,支气管基因表达和基因变异。
结果1型干扰素(IFN)全身的基因都与AWT,墙体面积的平方根的假想的气道10毫米内周长(Pi10)和墙面积百分比,AWT最强的浓缩。得分来自18个基因的表达与AWT与COPD-related表型包括减少肺功能(用力呼气量在1 s比例预测β=−3.4;p < 0.05),增加了急性加重(发病率比1.7;p < 0.05)。AWT得分是人工繁殖与AWT支气管样本来自23个学科(β= 3.22;p < 0.05)。血液AWT分数与基因变异rs876039有关,一种表达数量性状位点IKZF1一个基因,调节干扰素信号和与炎症相关疾病。
结论基因表达签名与IFN-stimulated基因外周血和支气管刷与CT AWT,肺功能和加剧。共享基因和基因关联显示病毒反应和/或自身免疫失调的潜在潜在机制在COPD气道疾病。
文摘
气道壁厚在慢性阻塞性肺疾病(COPD)与1型干扰素信号从外周血基因表达https://bit.ly/2WEjvFH
脚注
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COPDGene调查员——核心单位:行政中心:詹姆斯d·Crapo(π),埃德温·k·西尔弗曼(π),巴里·j·伊丽莎白·a·里根。遗传分析中心:特里-贝蒂Ferdouse,女王,彼得·j·卡斯塔尔迪迈克尔·赵黎明l .效用阿德尔r . Boueiz玛丽莲·g·福尔曼,搞清楚Halper-Stromberg,路司得·海登•克雷格·赫什Jacqueline Hetmanski布莱恩·d·霍布斯约翰·e·Hokanson南Laird,克里斯托夫•兰格莎朗·m·鲁茨Merry-Lynn麦当劳,玛格丽特·m·帕克,德米特里•Prokopenko丹迪巧,伊丽莎白·a·里根Phuwanat Sakornsakolpat,埃德温·k·西尔弗曼,艾米丽湾和Sungho赢了。成像中心:胡安-帕布鲁Centeno,让•保罗•Charbonnier哈维·o·Coxson克雷格•j•加尔美兰k .汉埃里克·a·霍夫曼斯蒂芬·汉弗莱斯,弗朗辛·l·雅各布森,Ella a . Kazerooni菲利普·f·朱迪亚历克斯·Kluiber大卫·a·林奇Pietro Nardelli,约翰·d·纽厄尔Jr Aleena公证,安德里亚哦,伊丽莎白·a·里根詹姆斯·c·罗斯,劳尔圣何塞Estepar,乔伊斯·施罗德Jered Sieren, Berend c·斯托尔Juerg Tschirren Edwin Van发现,布拉姆·范·Ginneken伊娃·范·Rikxoort冈萨洛拉斯维加斯Sanchez-Ferrero,卢卡斯Veitel乔治·r·Washko和卡拉·g·威尔逊。击球质量中心、盐湖城、UT:罗伯特詹森。数据协调中心和生物统计学,国家健康犹太人,丹佛,答:道格拉斯•埃弗雷特吉姆骗子,凯瑟琳·Pratte马特链和卡拉·g·威尔逊。安舒茨医学校园流行病学核心,科罗拉多大学奥罗拉有限公司:约翰·e·Hokanson Gregory Kinney莎朗·m·鲁茨和坎德拉年轻。死亡审判的核心:苏利耶p Bhatt,杰西卡好,亚历杭德罗·迪亚兹,梅兰k .汉巴里,苏珊•穆雷伊丽莎白里根,泽维尔•索和卡拉·g·威尔逊。生物标志物的核心:拉塞尔·鲍勒怀中Kechris和Farnoush Banaei-Kashani。
COPDGene调查员——临床中心:弗吉尼亚州安阿伯:杰弗里·l·柯蒂斯和佩里g . Pernicano。休斯顿贝勒医学院,TX:尼古拉Hanania, Mustafa Atik Aladin Boriek, Kalpatha Guntupalli,伊丽莎白的家伙,阿米特Parulekar。布莱根妇女医院,波士顿,MA:唐·杰里•迪米欧,亚历杭德罗·迪亚兹,路司得·海登布莱恩·d·霍布斯克雷格·赫斯,弗朗辛·l·雅各布森和乔治·Washko。纽约哥伦比亚大学,纽约州:r·格雷厄姆•巴尔贝琳达D’索萨约翰·奥斯汀和拜伦·托马斯休。杜克大学医学中心,达勒姆,NC:尼尔·麦金太尔小h·麦克亚当斯和莱西华盛顿页。Grady纪念医院,亚特兰大,乔治亚州:埃里克Flenaugh和Silanth萜。HealthPartners研究所、明尼阿波利斯、锰:Charlene McEvoy约瑟Tashjian。马里兰州巴尔的摩约翰斯·霍普金斯大学:罗伯特智慧,罗伯特·布朗纳迪亚n .汉斯,凯伦·霍顿Allison兰伯特和Nirupama Putcha。伦德奎斯特港加州大学洛杉矶分校医学中心生物医学创新研究所托兰斯,CA:理查德•Casaburi阿达米亚历山德拉,马修·Budoff汉斯•菲舍尔Janos Porszasz,哈利Rossiter和威廉·斯金格。迈克尔·e·DeBakey VAMC,休斯顿,德克萨斯州:阿米尔Sharafkhaneh和查理局域网。 Minneapolis VA: Christine Wendt, Brian Bell and Ken M. Kunisaki. National Jewish Health, Denver, CO: Russell Bowler and David A. Lynch. Reliant Medical Group, Worcester, MA: Richard Rosiello and David Pace. Temple University, Philadelphia, PA: Gerard Criner, David Ciccolella, Francis Cordova, Chandra Dass, Gilbert D'Alonzo, Parag Desai, Michael Jacobs, Steven Kelsen, Victor Kim, A. James Mamary, Nathaniel Marchetti, Aditi Satti, Kartik Shenoy, Robert M. Steiner, Alex Swift, Irene Swift and Maria Elena Vega-Sanchez. University of Alabama, Birmingham, AL: Mark Dransfield, William Bailey, Surya P. Bhatt, Anand Iyer, Hrudaya Nath and J. Michael Wells. University of California, San Diego, CA: Douglas Conrad, Xavier Soler and Andrew Yen. University of Iowa, Iowa City, IA: Alejandro P. Comellas, Karin F. Hoth, John Newell Jr and Brad Thompson. University of Michigan, Ann Arbor, MI: MeiLan K. Han, Ella Kazerooni, Wassim Labaki, Craig Galban and Dharshan Vummidi. University of Minnesota, Minneapolis, MN: Joanne Billings, Abbie Begnaud and Tadashi Allen. University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA: Frank Sciurba, Jessica Bon, Divay Chandra, Carl Fuhrman and Joel Weissfeld. University of Texas Health, San Antonio, San Antonio, TX: Antonio Anzueto, Sandra Adams, Diego Maselli-Caceres, Mario E. Ruiz and Harjinder Singh.
利益冲突:J.H. Yun报告从美国国立卫生研究院资助,在进行研究;外从桥Biotherapeutics个人费用,提交工作。
利益冲突:j .明天报告从美国国立卫生研究院资助,在进行这项研究的。
利益冲突:m .赵报告基因的个人费用,阿斯利康和Illumina公司外的拨款从拜耳和葛兰素史克公司,提交工作。
利益冲突:p·卡斯塔尔迪报告个人费用从葛兰素史克公司和诺华公司,葛兰素史克公司的拨款,在提交工作。
利益冲突:C.P.赫斯报道美国国立心、肺、血液研究所,在进行研究;从拜耳赠款,勃林格殷格翰的发言,诺华和顶点,武田和个人费用,外提交的工作。其余作者没有披露。
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- 收到了2021年2月23日。
- 接受2021年9月24日。
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