摘要
背景microRNA (miRNA)表达的改变可以促进包括哮喘在内的许多疾病的发病。我们旨在鉴定哮喘患者和健康对照之间差异表达的mirna,并探索它们与哮喘临床和炎症参数的关系。
方法采用线性回归模型,对79例哮喘患者和82例健康对照组的支气管活检进行小RNA测序,确定差异表达的miRNAs。差异表达的miRNAs与临床和炎症性哮喘特征相关。利用来自相同支气管活检的mRNA数据分析了潜在的miRNA-mRNA相互作用,并使用enrichment和g:Profiler鉴定了通路的富集。
结果在哮喘患者的支气管活检中,与对照组相比,共鉴定出78个差异表达的mirna,其中60个在控制吸烟和吸入皮质类固醇治疗后仍然存在差异表达。基于miR-125b-5p和miR-223-3p与多种临床和炎症性哮喘特征显著相关,以及它们与哮喘存在相关基因的负相关,我们鉴定了几种哮喘相关的miRNAs,包括miR-125b-5p和miR-223-3p。受miR-125b-5p和miR-223-3p影响最多的生物通路是炎症反应和纤毛组装/组织。有趣的是,我们发现miR-26a-5p的低表达与血液、痰和支气管活检中测量的更严重的嗜酸性炎症有关。
结论总的来说,我们确定miR-125b-5p, miR-223-3p和miR-26a-5p是潜在的调节因子,可能有助于哮喘的发病机制。
摘要
通过对哮喘患者和健康对照组的支气管活检进行小RNA测序,本研究确定了与哮喘临床和炎症特征相关的microRNAs,这些microRNAs是哮喘相关基因表达的潜在调节因子https://bit.ly/3rZXMDf
脚注
利益冲突:罗菲尔议员没什么可透露的。
利益冲突:I.M.布德维恩没有什么可透露的。
利益冲突:j.l.l van Nijnatten没有什么可透露的。
利益冲突:A.法伊兹没有什么可透露的。
利益冲突:C.J. Vermeulen没有什么可透露的。
利益冲突:A.J. van Oosterhout拥有葛兰素史克的股份。
利益冲突:阿弗莱克是葛兰素史克公司的员工。
利益冲突:W. Timens报告了罗氏诊断/Ventana、百时美施贵宝和Diaceutics的个人咨询费,以及MSD在提交工作之外的咨询和讲座的个人费用。
利益冲突:k·r·布拉克没什么可透露的。
利益冲突:T. Maes报告来自根特大学的资助(BOF19-GOA-008, BOF U4资助;05U40516)和佛兰德斯科学研究基金,在研究期间;葛兰素史克(GlaxoSmithKline)咨询委员会工作的个人费用、Chiesi公司的赠款(提交工作以外);他是Oryzon Genomics和Mendelion Lifesciences SL的股东。
利益冲突:I.H.海金克没什么可透露的。
利益冲突:C-ABrandsma没有什么可透露的。
利益冲突:M. van den Berge报告来自葛兰素史克、赛诺菲、诺华、基因泰克和罗氏的研究经费(支付给机构),在提交的工作之外。
支持声明:这项工作得到了与葛兰素史克公司(GlaxoSmithKline)的科研合作协议的支持,并由经济事务和气候政策部(Ministry of Economic Affairs and Climate Policy)通过顶级部门生命科学(Top Sector Life Sciences)提供的PPP津贴共同资助,以刺激公私合作伙伴关系。M.P. Roffel由U4项目资助(根特大学助学金BOF 05U40516)。本文的资助信息已存入交叉参考基金注册.
- 收到了2021年5月5日。
- 接受2021年7月30日。
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