摘要
关于出生时胞嘧啶-磷酸-鸟嘌呤(CpG)位点的DNA甲基化(DNAm)是否能预测肺功能发育模式,我们知之甚少。我们使用来自怀特岛f1代出生队列(IOWBC-F1)的足跟刺破dna来发现与前26年肺功能轨迹(1秒内的用力呼气量、用力肺活量、它们的比值以及用力肺活量25-75%时的用力呼气流量)相关的CpGs,并按性别分层。我们使用脐带血dna重复了雅芳父母与儿童纵向研究(ALSPAC)的发现。
应用全表观基因组筛选技术鉴定了396名IOWBC-F1男孩和390名女孩肺功能轨迹相关的CpGs。ALSPAC的复制主要集中在8岁、15岁和24岁时的肺功能。对具有统计学意义的重复CpGs进行了研究,以确定队列间关联方向的一致性、IOWBC- f1中DNAm随时间的稳定性、相关生物学过程以及与IOWBC f2代(IOWBC- f2)中基因表达(n=161)的相关性。
基因上8个CpGs的dna差异Glul, mycn, hlx, lhx1, cobl, col18a1, stra6,和WNT11在IOWBC-F1和ALSPAC中,它们与肺功能在同一方向上显著相关,并且在出生、10岁和18岁时在IOWBC-F1中表现出稳定的高肺功能和低肺功能轨迹。论文认定上LHX1和COL18A1与IOWBC-F2的基因表达有关。
在两个大型队列中,出生时的新型DNAm与青春期和成年早期的肺功能模式相关,为预防肺功能不良发展的预防性干预提供了可能的目标。
摘要
在两项基于人群的队列研究中,发现并复制了出生时与10至26岁肺功能相关的差异甲基化基因组位点。这些位点位于参与肺形态发生的基因上。https://bit.ly/37qtT6Z
脚注
本文的补充资料来自www.qdcxjkg.com
死后的作者已经给了教授A.约翰·亨德森他提出的分析和数据采集在ALSPAC的关键贡献。
利益冲突:慕克吉没有什么可透露的。
利益冲突:R. Arathimos没有什么可透露的。
利益冲突:陈冠希没有什么可透露的。
利益冲突:P. Kheirkhah Rahimabad没有什么可透露的。
利益冲突:L. Han没有什么可透露的。
利益冲突:H. Zhang没有什么可透露的。
利益冲突:J.W. Holloway报告了研究期间美国国立卫生研究院的资助。
利益冲突:C. Relton没有什么可透露的。
利益冲突:S.H. Arshad没有什么可透露的。
利益冲突:S. Ewart没有什么可透露的。
利益冲突:W. Karmaus没有什么可透露的。
支持声明:本研究得到了美国国立卫生研究院/国家过敏与传染病研究所的支持(R01 AI091905和R01HL132321给W.K, R01 AI121226给H.Z.和J.W.H.);英国全国哮喘运动(364);以及美国国立卫生研究院/国家心脏、肺和血液研究所(R01 HL082925至S.H.A.)。内容完全是作者的责任,并不一定代表美国国立卫生研究院和英国国家哮喘运动的官方观点。生成大规模甲基化数据的综合表观基因组学研究可访问资源(ARIES)由英国生物技术和生物科学研究委员会(BB/I025751/1和BB/I025263/1)资助。英国医学研究委员会综合流行病学小组和布里斯托尔大学(MC_UU_12013_1, MC_UU_12013_2, MC_UU_12013_5和MC_UU_12013_8), Wellcome Trust (WT088806)和美国国家糖尿病、消化和肾脏疾病研究所(R01 DK10324)支持对ALSPAC队列进行额外的表观遗传分析。英国医学研究理事会和惠康基金会(资助编号:102215/2/13/2)以及布里斯托尔大学为ALSPAC提供核心支持。本文的资助信息已存入交叉基金注册处.
- 收到了2020年4月22日。
- 接受2020年10月14日。
- 版权所有©ERS 2021