抽象的
跨国哮喘遗传联盟(TAGC)发现了878个与哮喘相关的SNPs。我们假设这些SNPs通过调节气道上皮的基因表达来影响哮喘的风险,并通过表达数量性状位点(eQTL)和介导分析来确定这些SNPs与哮喘的表达水平之间的直接联系CIS-有(n=228)和无(n=241)哮喘的波多黎各儿童的鼻(气道)上皮基因(1 Mb以内)。然后,我们检测了与TAGC SNPs相关的基因在过敏性哮喘中是否存在差异表达(DE)。我们鉴定了418个TAGC SNPs与55个TAGC表达之间的1150个直接关联CIS-基因。大多数snp调节距离独联体-Genes(平均距离~200 kB)。我们的调解分析表明,4571(89.2%)的5119(直接和间接)SNP-基因表达缔酶通过甲基化介导。在114个基因中,其表达与TAGC SNPS相关的基因,54是特应性哮喘的DE,包括新颖和先前报道的基因。在72个非洲裔美国儿童的独立队列中,54个基因中的50个可用,21(42%)也在特应哮喘中。因此,我们表明许多TAGC SNP与遥远的表达相关联独联体- 在气道上皮中的根本,这主要是通过DNA甲基化介导的。此外,近一半的基因在气道上皮中的表达与TAGC SNP有关,也可以在特征性哮喘中。我们的研究结果支持调节气道上皮基因表达对儿童特应性哮喘的关键作用。
脚注
此手稿最近被接受了出版物欧洲呼吸杂志。它是在我们的生产团队进行编辑和排版之前,以其公认的形式在这里出版的。在这些制作过程完成后,作者已经批准的结果证明,文章将移动到最新的一期erj.在线的。请打开或下载PDF以查看本文。
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- 已收到2019年8月30日。
- 接受2019年11月24日。
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