摘要
每当铜绿假单胞菌(PA)是从囊性纤维化(CF)患者气道培养的,主要目标是通过抗生素治疗根除。成功的定义是至少6个月的气道细菌培养阴性。然而,我们怀疑PA在没有临床检测的气道中长期存在。
在298例PA感染哥本哈根CF患者中,我们确定了80例完整的PA监测记录,并测量了他们的最大无PA根除期(MEP)。对72例患者的分离株进行了全基因组测序(n=567)和克隆分型。通过系统发育分析和表型多变量建模对选择菌株的亲缘关系进行检验。
69名患者(86%)在监测期间(2002-2018年)出现了根除。测序的分离株连接了42例患者的MEP, 18例(43%)患者的MEP具有相同的克隆类型。根除失败的患者平均接受更密集的抗生素治疗,但这可能与他们更严重的mep前感染轨迹有关。42例患者中,26例接受了鼻窦手术;大多数(15例)显示MEPs邻近手术,只有5例有持续克隆类型。重要的是,结合系统发育-现象评价表明,持续的克隆类型是同一菌株再次出现的结果,而不是来自环境的再次感染,配对的上、下气道样本和传播病例显示出相似的相关性。
综上所述,根据组学监测,近一半的CF患者可能并没有真正清除原来的细菌。这一独特的持续感染人群可能会受益于量身定制的抗生素治疗。
脚注
这份手稿最近已被《纽约时报》接受出版欧洲呼吸杂志.在我们的制作团队进行编辑和排版之前,它以接受的形式在这里发表。在这些生产过程完成后,作者已经批准的结果证明,文章将移到最新的问题收获网上。请打开或下载PDF以查看本文。
利益冲突:阎博士报告了国家卫生研究院的拨款,在进行研究期间;
利益冲突:Bartell博士报告了囊性纤维化基金会(批准号:BARTEL18F0)在研究进行期间的拨款;
利益冲突:索默博士没有什么可透露的。
利益冲突:Marvig博士报告了丹麦国家研究基金会(第126号)在进行研究期间的拨款;
利益冲突:斯科夫博士没什么可透露的。
利益冲突:普雷斯勒博士没有什么可透露的。
利益冲突:Molin博士报告了囊性纤维化基金会(grant# MOLIN18G0)在进行研究期间的拨款;
利益冲突:约翰森博士没有什么可披露的。
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- 收到了2020年3月1日。
- 接受2020年10月8日。
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