摘要
RT-PCR检测的Ct值与SARS-CoV-2感染的死亡风险相关。在校正年龄、性别、共病和住院情况的模型中,Ct值<20与>30的风险为2.20 (95% CI 1.28-3.76)。https://bit.ly/3gjuqdU
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通过对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)进行逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测,广泛诊断2019年冠状病毒病(COVID-19)。使用RT-PCR时,可以从阈值周期(Ct)值推断SARS-CoV-2的传染性[1.]。最佳做法是使用参考材料或已知病毒拷贝数的内部质粒对照来确认标准曲线的有效性[2.].由于Ct值表示信号超出阳性阈值的周期数,因此较低的Ct值表示较高的病毒载量。尽管一些研究表明病毒载量与死亡率和传染性有关[3.,4.],一项系统性回顾发现,有症状前、无症状和有症状患者的病毒载量差异不大[5.]因此,病毒载量的临床相关性仍然存在争议,并且没有在临床实践中使用[6.]在这里,我们报告了在英国苏格兰泰赛德地区鼻咽部联合拭子检测SARS-CoV-2阳性的人群的Ct值与全因死亡率之间的关系。这是一项社区队列研究,包括该地区的当地人群,以及接受了SARS-CoV-2症状检测的健康和社会护理工作者这是筛选计划的一部分[7.].为了获得检测呈阳性的患者的临床特征和结果,如前所述,在常规医疗数据集之间进行了匿名记录链接[8.]。包括2020年3月12日至5月1日期间的所有阳性PCR检测,以及2020年5月20日之前苏格兰国家记录记录的所有死亡病例。当地数据保护官员(Caldicott Guardian)批准匿名数据链接。
NHS泰赛德共记录1337例SARS-CoV-2阳性患者。在实验室中,提取了核酸,并使用ABI7500进行了针对RdRP基因的一步RT-PCR检测。对于多次检测呈阳性的个体,纳入第一次检测的Ct值,对于同一天多次检测,使用Ct值最低的检测。在我们的队列中,个体首次阳性试验的总体中位(四分位间范围)Ct值为28.7(23.9-33.4)。队列的中位(四分位间范围)年龄为53岁(40-72岁),61.9%为女性。202人(15%)因COVID-19住院(COVID-19的ICD代码为U07.1)。
队列中的死亡总数为161(12%),大多数死亡(102)发生在非医院队列中。然而,住院患者死亡的比例更高(29%,而未住院患者死亡的比例为9%)。这可能是由于老年护理院的感染率和死亡率很高。平均值±sd随访时间为37±14 天,最大随访时间为69天 15%的队列患有高血压,4%患有心力衰竭,9%患有缺血性心脏病,8%患有COPD,5%患有哮喘,8%患有慢性肾病,10%患有2型糖尿病。
采用调整相关临床因素的Cox比例风险模型检验Ct值与死亡率之间的相关性。这些是:年龄、性别、高血压、心力衰竭、缺血性心脏病、COPD、哮喘、慢性肾脏病和2型糖尿病。该模型显示初始Ct值与死亡率之间存在显著相关性(HR0.96,95%可信区间0.93–0.99;p=0.0044)。死亡率的其他独立预测因子是年龄(HR1.08,95%可信区间1.06-1.09;p<0.001)和男性(HR1.77,95%可信区间1.28-2.44;p<0.001)。
然后将Ct值分为高(>30)、中(20-30)和低(<20),并根据相同的临床因素构建模型(图1)这表明,与高初始Ct值相比,低初始Ct值与死亡率风险增加相关(HR 2.10,95%可信区间1.23–3.60;p=0.0069);然而,中等和高初始Ct值之间的相同关系在统计学上并不显著(HR 1.37,95%可信区间0.96–1.94;p=0.08)我们进行了一项敏感性分析,调整住院状态作为疾病严重程度的标志;在这项调整后的分析中,低初始Ct值将死亡率风险增加2.20(95%可信区间1.28–3.76;p=0.0005)。这些结果表明,疾病严重程度不会混淆Ct值与死亡率之间的关联。
早期识别COVID-19给个人带来的风险仍然是一项挑战。大多数COVID-19疾病的临床调查仅限于住院队列;在这里,我们能够评估Ct评分在社区中的价值。然而,由于这是一项社区队列研究,来自住院患者的临床调查数据无法帮助对整个队列进行疾病严重程度的分类。在这里,我们证明了个体首次SARS-CoV-2 PCR检测阳性的Ct值(指示病毒载量)与总死亡率之间的独立关系,其中Ct值越低,死亡风险越大。Ct值可以对COVID-19患者进行早期危险分层。需要进一步的工作来证实这种相关性,并评估Ct值在早期风险分层中的作用。
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脚注
利益冲突:R.Waudby West无需披露任何信息。
利益冲突:B.J. Parcell没有什么可披露的。
利益冲突:C.N.A.帕默没有什么要披露的。
利益冲突:贝尔没有什么可披露的。
利益冲突:J.D. Chalmers获得了葛兰素史克、勃林格殷格翰、阿斯利康、辉瑞、Grifols、拜耳、Polyphor和Insmed的研究资助;并从葛兰素史克、拜耳医疗、阿拉迪姆、格里福斯、辉瑞、勃林格殷格翰、纳普和Insmed获得咨询、国会差旅费或演讲费。
利益冲突:M.K.Siddiqui无需披露任何信息。
- 收到2021年2月5日。
- 认可的2021年6月2日。
- 版权所有©作者2021年。
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