抽象的
我们在NSCLC患者中举报了一种新的ALK融合伙伴,该患者对ALK抑制剂CRIZOTINIB良好http:///wly/7o6f309kyfb.
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到目前为止,在Nonsmall细胞肺癌(NSCLC)中发现了10多种不同的ALK融合伙伴:EML4,KIF5B,KLC1,TFG,TPR,HIP1,STRN,DCTN1,SQSTM1和BIRC 6,其中[1那2]。我们在此报告一种NSCLC患者的新型ALK融合伙伴,他对ALK抑制剂屈服肝胆苷效果很好。
在中国北京,2016年5月,中国北京总医院,一家没有吸烟历史的64岁的中国女性是因为咳嗽和呼吸困难。胸廓计算断层扫描(CT)显示右上叶,多个扩大的纵隔淋巴结和右胸部的胸腔积液(图1A)。在建立肺腺癌病理诊断后通过内核超声引导横切针吹针,oncomine焦点测定(OFA,Thermo Fisherciency,San Francisco,CA,USA)用于热点突变和基因融合检测。在离子PGM系统(Thermo Fisher Scientific,Waltham,Ma,USA)上进行了高通量测序。我们达到了149920 DNA测序读数,分别为2745252个RNA测序读数。所有测序读数与人类基因组(HG19)对齐,映射到ALK 5'和3'区域的读数用于ALK不平衡5'/ 3'表达分析。只有七个RNA测序读为ALK 5'区域,而10 366读被映射到3'区域。3'/ 5'不平衡值为0.06,大于0.015的阈值,这表明了融合的强大证据,并且在映射测序读取到已知的融合伴基因的同时获得负面结果。
由于新的ALK融合的存在,从2016年6月,每天250毫克的剂量暂时地规定了ALK抑制剂屈服。在屈曲1个月治疗后,症状改善,胸部CT表现出疾病的部分反应(图1B.)。截至2016年12月,患者仍然仍然存在于没有疾病复发的蠕动治疗。
此外,使用智能赛5'/ 3'套件(Takara,山景,CA,USA)来完成CDNA末端(RACE)的快速扩增,得到ALK融合序列,并在融合场上得到了1011bp序列。序列分析显示,该患者具有新的BCL11A-ALK融合(图1C.)。
已知位于人染色体2上的Bcl11a(B细胞Cl1 /淋巴瘤11a)在B细胞恶性肿瘤中发挥作用,并涉及包括B淋巴细胞,神经发生和促红细胞生物学的几种生物学方法[3.]。因为这种NSCLC患者患有新型BCL11A-ALK基因融合,所以表现出对ALK抑制剂屈服的部分反应,可以将BCL11A-ALK视为致癌融合基因,其应添加到ALK融合基因列表中。下一代测序显示出令人印象深刻的能力来检测荧光原位杂交(鱼类) - Negative Alk重新排列的NSCLC [4.[除了鱼类,免疫组化和RT-PCR基技术之外,进化为诊断临床实际的替代方案,用于诊断鱼,免疫组化和RT-PCR基技术。本研究保证未来调查患BCL11A-ALK融合基因的肺癌的临床特征和生物学特征。
脚注
利益冲突:没有宣布。
- 已收到2016年11月2日。
- 公认2017年1月3日。
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