肺动脉高压的多组学分析
巴勃罗Otero-Nunez,克里斯多夫罗兹,约翰沃顿商学院,伊米莉亚Swietlik,SokratisKariotis,拉尔斯Harbaum,马克邓宁,杰森Elinoff,尼娅埃林顿,罗杰汤姆森,詹姆斯Iremonger,格里Coghlan,保罗Corris,路加福音霍华德,大卫•吉利,科林教堂,乔安娜Pepke-Zaba,马克Toshner,斯蒂芬。麦芽汁,Ankit德赛,马克亨伯特,威廉尼克尔斯,劳拉索斯盖特,David-AlexandreTregouet,理查德。Trembath,印加Prokopenko,Stefan伯爵,尼古拉斯莫雷尔,丹尼斯王,艾伦Lawrie,马丁威尔金斯
欧洲呼吸杂志
2020
56:
4458;
DOI:10.1183/13993003.国会- 2020.4458
巴勃罗Otero-Nunez
1国家心肺研究所,帝国理工学院,伦敦,英国
马克·亨伯特
12Université巴黎南部,Faculté de Médecine, Université巴黎-萨克雷;AP-HP,肺气科,référence高血压肺炎中心,Hôpital Bicêtre, Le Kremlin-Bicêtre;INSERM UMR_S 999, Hôpital Marie Lannelongue, Le Plessis Robinson,巴黎,法国
David-Alexandre Tregouet
15INSERM UMR_S 1219,波尔多人口健康研究中心,波尔多大学,波尔多,法国波尔多
摘要
肺动脉高压(PAH)是一种罕见但具有高度异质性的患者群体和临床反应的疾病。血液的分子分析可以用来更好地了解潜在的病理。结合来自不同分析平台的输出有可能识别关键信号通路。
我们结合转录组学、代谢组学和基因组学分析来研究英国PAH队列中的PAH。对英国国家多环芳烃队列研究招募的多环芳烃患者的全血样本以及年龄和性别匹配的健康对照进行RNA测序。RNA发现、RNA验证/模型构建和模型验证三阶段设计用于定义一组鉴别RNA。我们使用多环芳烃全基因组关联研究的汇总统计数据进行了生存分析和孟德尔随机化分析。
我们在PAH患者与健康对照组中鉴定了507个表达差异的基因。在模型验证中,包含25个rna的LASSO模型能够区分PAH,准确率为87% (AUC 95% CI: 0.791-0.945),并且与PAH患者的长期生存相关。RNA和代谢组谱的组合最能从对照中区分多环芳烃(p=0.00175)。孟德尔随机化检测到SMAD5水平与PAH疾病易感性之间的相关性(OR:0.317, 95%CI:0.129-0.776, p=0.012)。
我们已经确定了PAH的全血RNA特征,其中包括与疾病发病机制相关的RNA,通过代谢组学特征提高了对PAH的区分,并识别出临床结果较差的患者。与低SMAD5表达相关的遗传变异可能会增加对多环芳烃的易感性。
脚注
引用本文为:欧洲呼吸杂志2020;56:增刊64,4458。
本摘要在2020年ERS国际大会“前COVID-19时代的呼吸道病毒”会议上发表。
这是ERS国际会议摘要。没有全文版本。本摘要的进一步资料可在www.ers-education.org(仅限ERS成员访问)。
- 版权所有©作者2020
肺动脉高压的多组学分析
巴勃罗Otero-Nunez,克里斯多夫罗兹,约翰沃顿商学院,伊米莉亚Swietlik,SokratisKariotis,拉尔斯Harbaum,马克邓宁,杰森Elinoff,尼娅埃林顿,罗杰汤姆森,詹姆斯Iremonger,格里Coghlan,保罗Corris,路加福音霍华德,大卫•吉利,科林教堂,乔安娜Pepke-Zaba,马克Toshner,斯蒂芬。麦芽汁,Ankit德赛,马克亨伯特,威廉尼克尔斯,劳拉索斯盖特,David-AlexandreTregouet,理查德。Trembath,印加Prokopenko,Stefan伯爵,尼古拉斯莫雷尔,丹尼斯王,艾伦Lawrie,马丁威尔金斯
欧洲呼吸杂志
2020年9月,
56
64(增刊)
4458;
DOI:10.1183/13993003.国会- 2020.4458
肺动脉高压的多组学分析
巴勃罗Otero-Nunez,克里斯多夫罗兹,约翰沃顿商学院,伊米莉亚Swietlik,SokratisKariotis,拉尔斯Harbaum,马克邓宁,杰森Elinoff,尼娅埃林顿,罗杰汤姆森,詹姆斯Iremonger,格里Coghlan,保罗Corris,路加福音霍华德,大卫•吉利,科林教堂,乔安娜Pepke-Zaba,马克Toshner,斯蒂芬。麦芽汁,Ankit德赛,马克亨伯特,威廉尼克尔斯,劳拉索斯盖特,David-AlexandreTregouet,理查德。Trembath,印加Prokopenko,Stefan伯爵,尼古拉斯莫雷尔,丹尼斯王,艾伦Lawrie,马丁威尔金斯
欧洲呼吸杂志
2020年9月,
56
64(增刊)
4458;
DOI:10.1183/13993003.国会- 2020.4458