拓扑数据分析(TDA) U-BIOPRED儿科外周血基因表达确定哮喘表型特征可变剪接的糖皮质激素受体(GR)的mRNA
詹姆斯p R。斯科菲尔德,珍妮特Bigler,迈克尔Boedigheimer,凯伦阿弗莱克,亚当泰勒,斯特Pavlidis,约翰H莱利,法比奥Strazzeri,格雷厄姆罗伯茨,JoostBrandsma,阿邦萨尔,本尼古拉斯,杨西安,安东尼罗,朱莉Corfield,苏珊威尔逊,乔纳森病房,刘若英附近地区,露易丝弗莱明,多明尼克肖,巴克每,马西莫卡鲁索,Sven-ErikDahlen,斯蒂芬。福勒,西蒙桥本,Ildiko霍法,彼得霍沃斯,诺伯特克鲁格,保罗Montuschi,MarekSanak,托马斯。),弗洛里安歌手,凯太阳,IoannisPandis,查尔斯Auffray,贝特朗de Meulder,黛安娜Lefaudeux,理查德。诺尔斯,尼尔。惠誉,安娜苏萨,伊恩爱德考克,Kian风扇钟,彼得斯德克已,保罗Skipp,姆也有
欧洲呼吸杂志
2018年
52:
PA5435;
DOI:10.1183/13993003. - 2018. pa5435国会
文摘
背景:儿童哮喘的分子分层可以实现靶向治疗。
目的:公正的分析,基因表达在儿科严重(SA)和温和/轻度哮喘(MA)识别sub-phenotypes的血液样本。
方法:转录组分析的微阵列分析血液U-BIOPRED儿科队列(弗莱明ERJ 2015),预处理和学龄儿童(SApre n = 62;MApre n = 42;SAsc n = 75:德文,n = 37)。拓扑数据分析(TDA)是用于无偏集群。
结果:Sub-phenotypes, P1, P2, P3和P4 TDA网络中识别并突出显示的图和一个热图所选变量中。P1(群体的38%,平均11岁)是糖皮质激素受体(GR)的特点是低表达的信使rna剪接变体具有悠久3’UTR (q = 2.43 e-17),但无显著差异在糖皮质激素受体(GR) mRNA的表达拼接变体与短3 ' UTR。在P1, COX2的表达(q = 1.89 e-06)和IFN-γ下跌(q = 5.61 e-06),类固醇降低反应的特征。
结论:无偏U-BIOPRED儿科外周血基因表达的分析确定了次表型,P1,抑制激素的反应。P1与低表达的剪接变体的GR长3 ' UTR。
脚注
本文引用:欧洲呼吸杂志2018 52:PA5435增刊。62。
这是一个人国际大会抽象。没有全文版本是可用的。进一步的材料来陪这个抽象可能可用www.ers-education.org(人队成员访问)。
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拓扑数据分析(TDA) U-BIOPRED儿科外周血基因表达确定哮喘表型特征可变剪接的糖皮质激素受体(GR)的mRNA
詹姆斯p R。斯科菲尔德,珍妮特Bigler,迈克尔Boedigheimer,凯伦阿弗莱克,亚当泰勒,斯特Pavlidis,约翰H莱利,法比奥Strazzeri,格雷厄姆罗伯茨,JoostBrandsma,阿邦萨尔,本尼古拉斯,杨西安,安东尼罗,朱莉Corfield,苏珊威尔逊,乔纳森病房,刘若英附近地区,露易丝弗莱明,多明尼克肖,巴克每,马西莫卡鲁索,Sven-ErikDahlen,斯蒂芬。福勒,西蒙桥本,Ildiko霍法,彼得霍沃斯,诺伯特克鲁格,保罗Montuschi,MarekSanak,托马斯。),弗洛里安歌手,凯太阳,IoannisPandis,查尔斯Auffray,贝特朗de Meulder,黛安娜Lefaudeux,理查德。诺尔斯,尼尔。惠誉,安娜苏萨,伊恩爱德考克,Kian风扇钟,彼得斯德克已,保罗Skipp,姆也有
欧洲呼吸杂志
2018年9月,
52
62(增刊)
PA5435;
DOI:10.1183/13993003. - 2018. pa5435国会
拓扑数据分析(TDA) U-BIOPRED儿科外周血基因表达确定哮喘表型特征可变剪接的糖皮质激素受体(GR)的mRNA
詹姆斯p R。斯科菲尔德,珍妮特Bigler,迈克尔Boedigheimer,凯伦阿弗莱克,亚当泰勒,斯特Pavlidis,约翰H莱利,法比奥Strazzeri,格雷厄姆罗伯茨,JoostBrandsma,阿邦萨尔,本尼古拉斯,杨西安,安东尼罗,朱莉Corfield,苏珊威尔逊,乔纳森病房,刘若英附近地区,露易丝弗莱明,多明尼克肖,巴克每,马西莫卡鲁索,Sven-ErikDahlen,斯蒂芬。福勒,西蒙桥本,Ildiko霍法,彼得霍沃斯,诺伯特克鲁格,保罗Montuschi,MarekSanak,托马斯。),弗洛里安歌手,凯太阳,IoannisPandis,查尔斯Auffray,贝特朗de Meulder,黛安娜Lefaudeux,理查德。诺尔斯,尼尔。惠誉,安娜苏萨,伊恩爱德考克,Kian风扇钟,彼得斯德克已,保罗Skipp,姆也有
欧洲呼吸杂志
2018年9月,
52
62(增刊)
PA5435;
DOI:10.1183/13993003. - 2018. pa5435国会