抽象的
背景:在机械途径信息的基础上合并多个'OMIC数据集是揭露基因型 - 表型关系的不断发展的方法(Ritchie等,NAT Rev Genet,2015)。
目标:1.发展综合重建七穗性代谢。2.从哮喘患者映射多OMICS签名(Handprint)。3.提供综合解释和派生假设。
方法:Eicosanoid途径是通过挖掘文献和策划的良好数据库(例如,Metacore)建造的,以SBGN标准(www.sbgn.org)提供,并通过域专家进一步编辑。多OMICS签名来自U-Biopred血液Handprint分析(De Meulder等,ers国际会议2015年)通过谷歌地图API使用Minerva平台(http://asthma.uni.lu/)可视化。
结果:将基因表达的差异和两种表型簇之间的唾液蛋白水平进行映射。这些群集含有U形化数据中最严重的哮喘患者。显示了PGD2衍生物和异丙醇的不同谱,表明这些患者的不同治疗途径。此外,突出了对白三烯代谢的调节,提出了5-脂氧合酶和甘草醛的5-脂氧基酶活性蛋白质或下游LTC4合酶和LTA4水解酶作为药物靶标。
结论:指向同一疾病相关分子过程的多种证据的整合是数据分析和解释的强大工具。这开始为治疗哮喘的特定表型来提供新的生物洞察和假设。
致谢:由创新的药物倡议提供资金(U-Biopred N°115010,etriks n°115446)。
来自植物糖的果香酸产生,具有多OMICS数据映射。
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