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在囊性纤维化(CF)和非CF支气管扩张(NCFBR)慢性假单胞菌铜绿假单胞菌感染对预后有不利影响[1那2].在CF,具有特定克隆的流行性感染P.铜绿假单胞菌与进一步的不利结果有关[3.那4.].这种交叉感染风险导致患者的分离[5.].有很少的数据P.铜绿假单胞菌NCFBR的交叉感染。结果,NCFBR中的分离尚未在指南中得到解决[6.].
我们的目标是在NCFBR进行交叉感染研究。这是在英格兰东北(英国)的成年支气管疾病服务中进行的,该服务与区域CF单位(2英里(3公里)距离)。该服务于2007年启动,每周专业诊所没有A.假单胞菌特殊诊所。当NCFBr患者住院时,人们倾向于基于隔间(单病房)的管理,但当没有隔间时,患者将在6个床位的隔间中管理。所有患者均经ct证实,主要为特发性或感染性后支气管扩张,根据目前的指南排除CF [6.].该研究获得了伦理许可和Caldicott批准(纽卡斯尔和北泰恩赛德国家研究伦理服务委员会)。
选择56个分离物用于分析。作为实验室控制,从CF患者中选择了六种。50是从40个NCFBR患者2008年至2011年间收集的NCFBR分离物。随机选择36例患者(患者1-36款)随机选择参加成人支气管扩张服务。纵向分离株包括10名平均(范围)16个月(2-35个月)之间的患者(2-35个月)。此外,单分离物选自四个NCFBR患者(患者37-40款),因为潜在的患者控制尚未参加专业诊所并且没有住院。分离物从自发痰中培养并鉴定为P.铜绿假单胞菌通过常规生物化学方法和基质辅助激光解吸/电离 - 飞行时间(MALDI-TOF)质谱法。
我们使用了两种基因分型方法;在每种情况下,测试都是盲目的。首先,我们根据制造商的协议使用了ArrayTube(在基因分型,耶拿,德国)。该系统在保守范围内检测13种单核苷酸多态性P.铜绿假单胞菌基因和辅助基因组中38种可变遗传标记的存在/不存在。将数据转换为四位数的十六进制代码,然后与数据库进行比较[7.那8.].其次,我们使用基于在九个可变基因组的基因组的指定位点的DNA数量的变化的变化使用可变数量串联重复(VNTR)分析[9.]与VNTR数据库比较[10].
36名接受服务的NCFBr患者(患者1-36)中,绝大多数患者携带自己的病毒(图1).11例和27例患者有不同的克隆C变种,这是一个在全球广泛发现的谱系[10];非生长对照组中的两名患者还具有该克隆(39和40款)的进一步变体。在参加该服务的34名剩余的NCFBR患者中,有三对(患者2和34; 12和19;和16和17)其孤立的P.铜绿假单胞菌通过至少一种方法共享非常相似的概要文件(图1).对于患者12和19,这是通过脉冲场凝胶电泳证实的SpeI-消化的基因组DNA;这是一个不寻常的概况,并且这些患者几乎肯定会反映交叉感染。患者2和34都有一个广泛发现的属于序列类型27型,而患者16和17患者通过VNTR显然是不同的菌株,表明只有一个可能的交叉感染情况。
NCFBr分离株的位置在更广泛的种群结构中P.铜绿假单胞菌,根据AT基因型绘制(未显示),并证明NCFBr菌株广泛分布。AT分析发现与AT数据库有几个模式匹配:匹配的是AT克隆A2, K, E, I, A7, A, L, J, A5和u。两种方法都能正确地识别出CF患者已知的对照菌株。
检查10名患者的纵向分离株(患者3,6-11,14,16和18岁)。对于九个患者,第一和第二分离株通过AT和VNTR基因分型难以区分,确认初始菌株的持久性。在一个患者(患者11)中,VNTR分析表明,两种分离株都是相同的,但在基因分型并没有。
我们的主要发现是没有主导克隆P.铜绿假单胞菌几乎没有跨感染的证据和许多“独特”的菌株。虽然在眼角膜炎中的克隆类型存在不同的聚类,但NCFBR的分离物被广泛分布在假单胞菌人口结构。综上所述,散在感染是NCFBr中最常见的感染模式。克隆C仅在6%的NCFBr患者中发现,并且已知在环境中广泛分布[8.].随着VNTR型材在两个或三个基因座中变化,似乎不太可能克隆C似乎不太可能,这表明它们被独立获得。其他分离株与先前与各种临床和环境源隔离的隔离物相匹配[8.].这些数据可能表明NCFBR中的环境获取风险[5.那8.].
没有占主导地位的P.铜绿假单胞菌克隆在NCFBr中可能反映了许多因素,包括低发病率P.铜绿假单胞菌与CF(≤80%)相比,NCFBR(<50%)感染。与CF相比,NCFBR的可能较低的住院率也可以限制交叉感染暴露。我们的NCFBR中心中使用的标准感染防治措施比指定的CF中心所实施的标准感染和控制措施不太严格。因此,由于较高的感染控制实践标准,因此,本发明的显着交叉感染不太可能。
值得注意的是,我们的研究完全专注于P.铜绿假单胞菌交叉感染和我们不能排除NCFBR人群中的交叉感染金黄色葡萄球菌那流感嗜血杆菌杆菌复合菌群或非结核分枝杆菌。此外,我们研究的局限性包括单中心设计。如果我们的NCFBr中心设施与我们的区域CF诊所共享,我们的观察结果可能会有所不同。因此,我们提倡进一步的多中心研究来确定交叉感染的风险。
脚注
支持声明:a . De Soyza承认英国高等教育资助委员会提供的高级讲师职位和资金国家卫生研究所纽卡斯尔生物医学资源中心老年和慢性疾病。
利益冲突:披露可以在本文的在线版本旁边找到www.www.qdcxjkg.com.
- 收到了2013年9月25日。
- 公认2013年10月16日。
- ©ers 2014.