文摘
目标发现气道基因表达改变与射线支气管扩张(是)可以提高早期的病理学的理解。
方法射线在173个人面前没有被评估的临床诊断。从这些人支气管刷transcriptomically描述和分析。单细胞进行反褶积估计细胞景观的变化可能与早期疾病进展相关。
结果20个参与者普遍影像学(≥3叶)。转录组分析反映出生物过程与被包括在细胞粘附相关基因的表达减少和炎症通路相关基因的表达增加(655个基因罗斯福< 0.1,日志2叠化> 0.25)。反褶积分析表明,射线与纤毛的比例增加,deuterosomal细胞和基底细胞的比例下降。基因表达模式分离参与者分为三个集群:正常,中间,bronchiectatic。bronchiectatic集群被参与者有叶的射线被浓缩(p < 0.0001),症状(p = 0.002),高SERPINA1变异率(p = 0.03),和更高的CT-derived得分(p < 0.0001)。
结论基因参与细胞粘附,WNT信号,ciliogenesis,和IFN-γ通路改变表达式与广泛的射线是参与者的支气管,可能与降低基底和纤毛细胞增加。这种基因表达模式不仅是个体之间的高纯度与射线,也与那些没有可辨别的影像学airway-related症状有关,这表明它反映了有关但non-BE特定肺pathophysiogic过程。
脚注
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利益冲突:亚历杭德罗a·迪亚兹报告临时专利基因签名识别向美国专利商标局提交的支气管扩张(专利的小说文章检测呼吸道疾病和障碍)在提交工作。
利益冲突:迈克尔·赵报告从葛兰素史克赠款,拜耳公司;从阿斯利康咨询费,基因泰克公司;讲座从Illumina公司谢礼;在提交工作。
利益冲突:亚当·高尔半岛报告资助来自诺华、强生(Johnson & Johnson)免疫学;在提交工作。
利益冲突:Avrum Spira报告公司一名前雇员。
利益冲突:丹尼斯Aberle报告赠款从美国放射学院,波士顿大学,国立卫生研究院/ NCI (R01 CA226079, U01 CA233370, R01 CA210360, U01 CA214182),皇帝基础研究所/ PCORI (');旅游支持从美国医学和生物工程研究所(AIMBE),克利夫兰诊所,专业卓越计划的研究(孢子)车间、国际研究协会的肺癌(IASLC);在提交工作。
利益冲突:乔治·r·Washko报告从国家卫生研究院资助,国防部;勃林格殷格翰集团咨询费,CSL贝林,葛兰素史克、诺华、飞利浦、顶点药品;旅行的支持飞利浦;参与与Pulmonx顾问委员会;在提交工作。此外,Washko博士是一位联合创始人和普通股持有人在定量成像解决方案,公司提供咨询服务的图像和数据分析。Washko博士的配偶生原体。
利益冲突:Ehab Billatos赠款NIH (1 r01hl149861-01a1)报道,诺华生物医学研究所的研究,国际研究协会的肺癌;专利申请的研究范围从波士顿大学本手稿中描述;在提交工作。
利益冲突:马克Lenburg报告约翰逊和约翰逊,诺华生物医学研究所;从约翰逊和约翰逊咨询费;专利申请的研究范围从波士顿大学本手稿中描述;在提交工作。
利益冲突:所有其他作者没有披露。
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- 收到了2022年1月18日。
- 接受2022年8月15日。
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