文摘
人物介绍:之前宏基因组研究哮喘临床表现型受限于不一致为了解细菌鉴定和测序深度不足。我们假设慢性细菌感染是我)的治疗特点的流行,临床表型和可靠的生物标志物需要定义和ii)是最好的特征使用纳米孔测序。
目标/方法:Illumina公司MiSeq比较性能,纳米孔测序,RT-qPCR总DNA提取与文化/ MALDI-TOF分析诱导痰液样本well-phenotyped严重的哮喘。
结果:在23个患有严重哮喘患者流感嗜血杆菌通常培养(n = 8/23),确定为占主导地位的细菌物种通过宏基因组测序使用MiSeq和纳米孔。纳米孔提供优越的操作对策,再读取长度允许整个细菌基因组重建物种之间和更高的分辨率。临床上显著的感染与验证确认H.infplasmid-based RT-qPCR化验。H.inf文化积极的患者痰嗜中性和FeNO低。
结论:H.inf是严重的临床相关病原体ashma和标识使用分子微生物方法可靠。这些优化的应用协议进行分析三大病人组允许完整的描述的临床表型。
脚注
本文引用:欧洲呼吸杂志2020;56:5。64年,4930年。
这个抽象是2020人队国际大会,在会议“呼吸道病毒的“pre COVID-19“时代”。
这是一个人国际大会抽象。没有全文版本是可用的。进一步的材料来陪这个抽象可能可用www.ers-education.org(人队成员访问)。
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