摘要
肺纤维化是一种致命疾病,呼吸功能逐渐丧失。导致端粒缩短的端粒维护是肺纤维化的原因,作为端粒酶组分基因的突变TERT(逆转录酶)和TERC(RNA成分)的家族性肺纤维化(FPF)的情况下的15%中找到。然而,到目前为止,大约85 FPF%的基因仍然未表征。
在这里,为了查明FPF的新的遗传原因,我们进行了全基因组测序,与候选基因的办法,47个受影响的科目从35个家庭有没有FPFTERT和TERC突变。
我们在端粒延伸调节因子helicase 1 (RTEL1.)四个家庭。RTEL1是一种DNA解旋酶,在DNA复制、基因组稳定、DNA修复和端粒维护中发挥作用。杂合RTEL1.在FPF中作为常染色体显性特征分离的突变,并通过结构分析预测严重影响RTEL1的功能和/或稳定性。与此一致的是,RTEL1.- 与年龄匹配的对照相比,患者表现出短端粒。
我们的结果提供了杂合的证据RTEL1.突变对FPF负责,从而延长RTEL1缺乏的临床频谱。因此,RTEL1.增加了与FPF有关的端粒相关基因的数量。
摘要
全末端测序显示杂合RTEL1.具有短端粒的家族性肺纤维化的突变http://ow.ly/LHvor
介绍
肺纤维化是用来描述一组纤维化在远端肺,其特征在于细胞外基质和成纤维细胞的积聚间质性肺疾病(的ILD)的总称。肺纤维化可导致从环境暴露例如纤维化的灰尘或气雾化有机抗原,药物毒性,或全身性疾病吸入如结缔组织疾病,或发生作为分离的,散发性疾病无肺外受累(特发性间质性肺炎)。一世D.一世opathic pulmonary fibrosis (IPF) is the most frequent (60%) and severe presentation, with a median age at diagnosis of 66 years and median survival of 3–5 years [1那2].
大多数肺纤维化病例是散发性,并且发生在没有家族病史的人的人们中,但同一家庭的两个或更多个成员的肺纤维化的发生越来越受到了案件的5-10%。肺纤维化的最常见的遗传传播模式是常染色体的优势。家族和散发性的肺纤维化疾病是临床和组织学上难以区分的,但家族性肺纤维化(FPF)倾向于呈现早期的年龄,在放射模式中可能略有不同[3.].
FPF与两组主要基因的突变有关[4.]参与表面活性剂代谢(SFTPC(表面活性蛋白C),sftpa2.(表面活性剂蛋白A2)和ABCA3(ATP粘合盒亚家族A,构件3)[5.那6.])或端粒维持(TERT(逆转录酶),TERC(RNA组分),DKC1中(dyskerin)和TINF2.(TRF1相互作用核蛋白2(TIN2))[7.-10.])。突变SFTPC很少在FPF中描述[11.]没有致病变异SFTPC在73名纽芬兰先证者[发现12.].的杂合突变的TERT是最常见的突变,在约15%的FPF中观察,而杂合突变TERC更为罕见(少数%)[7.那8.那12.].DKC1中代表了最近在两名男性先证者身上发现的导致FPF的第三个端粒相关基因[13.].值得注意的是,TERT那TERC和DKC1中突变主要描述存在作为负责先天性角化不良,具有短端粒相关联的骨髓衰竭疾病。有趣的是,最近,肺部疾病是先天性角化不良患者中约20%的发现与基因突变TERT那TERC,DKC1.和TINF2.[10.那14.,进一步论证端粒缺陷与IPF发病机制之间的联系。由于短端粒是许多IPF病例的标志,因此从理论上讲,与端粒维持有关的基因可以被认为是IPF的候选基因。总的来说,约15%的FPF病例中发现了突变,而85%的病例在基因上仍未确定。为了发现FPF的新分子原因,我们对来自35个有FPF但没有FPF的家庭的47例患者进行了全外显子组测序(WES)分析TERT和TERC突变。我们在端粒延伸调节因子helicase 1 (RTEL1.)在四名患者中(10%的FPF家庭),识别RTEL1.缺乏作为我们的队列中FPF的主要遗传原因。RTEL1是ATP依赖性DNA Helicase [15.]参与DNA复制,基因组稳定性,DNA修复和端粒维护[16.].最近,使用同样的方法,C奥根等.[17.的杂合突变RTEL1.在九个fpf家庭。此外,含有的基因座RTEL1.与平均端粒长度有关[18.].我们的发现加强了端粒维持和肺纤维化之间的联系,并提示端粒维持相关的基因突变可能占到FPF病例的25%。
方法
主题
200例有FPF的先证者及其亲属进行了分子探索TERT和TERC从2008年到2013年法国罕见肺病专家中心的基因研究。在此期间,比查特医院的遗传学部门是唯一一家进行基因测试的法国实验室。所有患者都签署了基因分析同意书,包括用于研究。法国呼吸医学学会的一个机构审查委员会Société de Pneumologie de Langue française批准了该研究方案。通过双向Sanger测序,我们鉴定出22个杂合子TERT24例患者的突变和四种杂合子变异TERC在六名患者中[19.].TERT和TERC在170个独立家庭中排除了170个证书中的突变。作为探索性的步骤,我们选择了35个“未解释的”家庭,没有突变的突变,以在端粒酶复合物中用于WES分析。审查患者的临床图表并在标准化的匿名收集表格中收集数据。临床数据,胸部计算断层扫描(CT)扫描和肺组织学结果被系统地审查,由多学科团队分析,并根据2011年美国胸部社会(ATS)/欧洲呼吸协会(ERS)/日本呼吸学会/拉丁美洲分类188bet官网地址关于IPF的胸部社会声明和2013年的特发性间质肺炎的分类[2那20.].包括感染病例最多的家庭和/或有几个感染个体的DNA样本的家庭,以便保留两个个体之间共同分离的变异。根据以下几个标准,我们选择35个未解释的欧洲家庭进行外显子组测序分析:FPF(至少2例肺纤维化)的确认,以及临床资料、胸部CT扫描和肺组织学发现的可用性。在35个被选中的家庭中,有12个家庭的DNA样本也可用于另一个受影响的对象。35个未解释家庭包括14个已知肺纤维化2例,17个已知肺纤维化3例,3个已知肺纤维化4例,1个已知肺纤维化5例。47例受检者(35例男性,10例女性)提交DNA进行WES。
WES和生物信息学分析
全人exome测序由otherentics(Norcross,Ga,USA)进行,其中Agilent V5(安捷伦Technologies,Santa Clara,CA,USA)和PE Illumina Hiseq2000(Illumina,San Diego,CA,USA)测序,估计50- 折叠平均覆盖范围。通过使用挖掘机轮对准器将序列与参考人类基因组HG19对齐。下游处理涉及基因组分析工具包(GATK)(https://www.broadinstitute.org/gatk/),SAMtools(www.htslib.org)及皮卡德(http://broadinstitute.github.io/picard/),按照记录的最佳实践[21.].创建变体调用涉及GATK统一的基因键。所有变体都使用巴黎Descartes大学生物信息学平台(法国巴黎)开发的软件系统注释。注释过程基于EnsemBl V72数据库(www.ensembl.org.).查询和过滤需要使用POLYWEB,这是一个内部生物信息学工具(Imagine Institute, Université Paris Descartes)。我们将WES与候选基因方法相结合来鉴定新的FPF基因。
RTEL1.根据若干标准保留变体作为疾病引起的疾病突变:在数据库中的突变(<1%)之类的突变(<1%)的罕见或罕见频率(如Exme Variant Server)()http://evs.gs.washington.edu/EVS/)或1000基因组数据库(http://browser.1000genomes.org/index.html);在几个独立家族的所有受影响个体中存在罕见变异;以及根据分子建模后的结构预测来预测具有致病性的变异(如。移码突变;影响保守氨基酸的非同义突变,并预测将影响蛋白质的三维结构和功能。
35个家庭的WES数据分析证实了突变的缺失TERT和TERC并没有发现端粒酶相关基因的任何突变DKC1中和TINF2.,也不在SFTPC,SFTPA2和ABCA3基因。
RTEL1测序
为了确认有型证据DNA鉴定的突变的存在,并与家庭中的表型研究突变的CoSegreation,我们测序外显子携带RTEL1.双向荧光测序的突变(引物序列可根据要求提供)并将它们与两个主要的参考序列进行比较RTEL1.人类细胞内表达的转录本[22.](1219氨基酸(AA)同种型:NM_016434.3 / NP_057518.1; 1300-AA同种型:NM_032957.4 / NP 116575.3),其在外显子34和35中不同。对于cDNA序列NM_032957.4,一些序列差异存在在参考数据库之间。
端粒长度测量
端粒长度通过端粒限制性片段(TRF)测定。从全血细胞中提取的基因组DNA (800 ng)经消化欣fI和Rsa在0.7%的琼脂糖凝胶上分解的I酶,转移到尼龙膜上,并使用EasyHyB溶液(Roche,Basel,瑞士)杂交,具有γ-32.p标记(ttaggg)4.调查。洗完后,端粒探测的Southern印迹暴露在磷酸化成象仪上,并用ImageJ (http://imagej.nih.gov/ij/).然后将数字化信号数据转移到Excel(Microsoft,Redmond,WA,USA)中,用于使用公式计算平均TRF长度: 哪里od.一世积分信号强度是否在位置一世和L.一世是DNA片段的位置的长度一世.身体健康,年龄匹配的对照(n = 13)在法国招募了同意。使用匿名DNA样品进行对照的端粒长度的测量。
分子建模和3D结构可视化
我们使用了RTEL的N末端RAD3相关DNA螺旋核心的序列1,以搜索使用HH-PRED的已知3D结构的相似性[23.],phyre2 [24.]和i-tasser [25.].基于他们的结果,我们使用modeler v9.14为这个核心创建了一个3D结构模型[26.]和热原体属acidophilumXPD(税收)作为模板(蛋白质数据库参赛2VSF和4A15 [27.那28.];HH-PEAT E-VALUE 1.1×10-74, Phyre 2 confidence 100 and I-TASSER C-score−0.73)。虽然这两个序列只有21%的序列同一性,但DNA解旋酶核心是很好的保守的(参见在线补充资料的比对细节)。RTEL1序列在循环中显示了一些在古细菌模板中不存在的大插入。此外,古菌XPD和真核生物RTEL1 ARCH结构域的比对显示出更高的序列差异,只有使用敏感的比对方法才能得到细化(我们未发表的结果)。3D模型的质量是通过检查各种结构特征和立体化学性质(数据未显示)来评估的。然而,应该注意的是智人RTEL1和taXPD序列并不影响我们分析的可靠性,因为突变发生在两个蛋白质之间高度保守的区域(参见在线补充材料)。第一个类谐域的三维结构模型来源于Fa等.[29.].
结果
在FPF患者中鉴定杂合突变RTEL1
为了确定新的FPF遗传原因,我们对来自35个家族的47例FPF患者进行了WES分析。在进行WES之前,Sanger测序已经排除了已知的主要fpf相关基因的突变,即TERT和TERC.使用的过滤器和查询是罕见的变异,预测是与端粒生物学相关的基因致病。因此,我们确定了杂合子RTEL1.来自四个独立家庭的四个证据中的突变(家庭A,B,C和D)(图1a和表1).四个中的三个RTEL1.突变是错义突变,在对应患者AII.2到c.146C> T,P(Thr49Met)取代外显子3。在患者BII.1到c.637C> T,P(Arg213Trp)取代外显子8。和在患者CII.2到c.2890T>第(Phe964Leu)外显子30的第四替换RTEL1.患者DII.1中鉴定的突变是外显子33中的1bp的复制,导致架构和过早止段密码子(C.3493dupc,p。(gln1165profs * 22))(图1B.).杂合氨基酸改变p.Phe964Leu在患者CII.2在纯合状态此前报道与Hoyeraal-赫雷达尔森(HH)综合征的患者中发现30.]具有替代的命名法基于不同的RTEL1.剪接变体(C . 2964t >G, p.(Phe988Leu)),并对应不同的核苷酸变化(1219-和1300-aa亚型的命名:我们患者中的2890T>C和之前的患者中的C . 2892t >G [30.])。近年来,双等位基因突变RTEL1.据报道患者HH综合征,先天性角化不良的严重变型中,其特征在于,早发性骨髓衰竭,免疫缺陷和发育缺陷与异常短端粒[相关联22.那30.-33.].这清楚地证明了p。(PHE964LE)突变的致病性。
四个都不是RTEL1.在1000个基因组中,Exome Variant Server(> 6500个体)中存在突变(> 6500个)www.1000genomes.org.)数据库或我们内部数据库(4237个人)。此外,三种RTEL1取代(p。(thr49met),p。(arg213trp)和p。(phe964leu)位于高度保守的地区(图1c)预测,通过预测工具,氨基酸取代如Polyphen-2 [34.],筛选[35.]和MutationTaster [36.].结合的注释依赖性耗竭评分分析也针对每个突变进行,获得高分化,得到致病性突变的结论(在线补充材料)。基因组进化率分析以评估突变靶向的区域的保护表明,由畸义突变靶向的核苷酸非常保守(在线补充材料)。
最后,我们通过荧光测序确认,COSEGREGATIONRTEL1.具有肺纤维化表型的三个家庭中有肺纤维化表型的突变(不首先包含在Exome测序项目中,因为它们在那时无法获得)(图1a).B家族的遗传假设是致病突变主要由受感染的母亲(BI.2)传播,但由于缺乏生物学材料,无法对她进行分析。如预期,健康的父亲(BI.1)不携带p.(Arg213Trp)RTEL1.突变。4个家庭的WES数据分析RTEL1.突变证实了在TERT和TERC,以及参与端粒维持其他基因和先前在人类疾病有牵连,例如DKC1中那TINF2.(编码TIN2),NOP10.(核仁蛋白10),NHP2(编码核糖核蛋白(RNP)), WRAP53(编码端粒酶和卡哈尔体蛋白1)[14.],CTC1.(保守的端粒封蛋白1)[37.),ACD.(编码三肽基肽酶1)[38.(数据未显示)。
临床评论
来自四个家族的9例FPF患者中有8例的临床资料完整(图1和表1).RTEL1.目前所有六个患者提供DNA样本中的突变。
家庭A.
来自家庭A的证据是一名48岁的男性吸烟者,诊断为IPF(图2c).他最初接受了AzathioLine,类固醇和NgydF4y2Ba乙酰半胱氨酸。硫唑嘌呤耐受性良好。急性加重的IPF治疗类固醇和环磷酰胺。患者出现中性粒细胞减少(<0.5 G·L)-1)在第一次输注环磷酰胺后1周,其自发地解决。他在初步诊断后21个月死于肺纤维化进展。他的母亲是一名66岁的Nonsmoker,诊断为IPF。她接受了口服环磷酰胺和类固醇,表现出(<0.5g·l)-1),在停用环磷酰胺后溶解。患者接受硫唑嘌呤治疗,无血细胞减少,诊断后48个月死于呼吸衰竭。他的姐姐是一个40岁的吸烟者,患有2期肺结节病,实际上病情有所缓解,但仍然表现为间质性肺炎。姐姐第一次CT显示淋巴分布的小结节,进一步CT消失,在基底胸膜下网状物上叠加,并有轻微的毛玻璃样混浊,进一步CT仍可见;最初的支气管活检显示有肉芽肿,支气管活检未作进一步评估(图2D.).患者无症状,直到随访2年才接受治疗。
家庭B.
来自B家族的先证者是一名27岁的轻度吸烟者,诊断为IPF (CT显示可能为通常的间质性肺炎(UIP),肺活检显示为UIP)。在BUILD-3试验中,他接受了波生坦或安慰剂治疗。患者IPF急性加重(图2B.)和接受肺移植,然后通过霉酚酸酯Mofetil,环孢菌素和皮质类固醇接受组合治疗。他开发了慢性拒绝,并在19个月后接受了新移植,并拒绝了第二个移植物。他分别在第一次肺移植和诊断后死于51和69个月。他没有myelodysplasia。他的母亲是一名33岁的非商民,根据她的家庭,肺纤维化。医疗文件无法审核。患者在初步诊断后30个月内死于呼吸衰竭。
家庭C.
C家族的先证者,49岁男性,吸烟,类风湿关节炎,肺受累(CT UIP模式,上叶肺气肿)。他经历了缓慢下降的肺功能,尽管治疗硫唑嘌呤和类固醇,没有细胞减少。发生肺癌(腺癌)。他在诊断为ILD后107个月去世。
他的兄弟是一个50岁的吸烟者,肺纤维化(CT上可能的UIP图案,肺活检)未进行)。他接受了皮质类固醇,经历了肺功能缓慢下降。他急性加剧,但没有接受特异性治疗,并在肺纤维化诊断后109个月死亡。他们的父亲呈现了数字俱乐部,但他的肺状况未知。
家庭D.
来自家族D的证据是一名56岁的男性吸烟者,肺纤维化和CT扫描的可能UIP图案(图2一个);未行肺活检。他出现骨骼异常:左手两指发育不全,右手三指发育不全,左股骨短10厘米。尽管在TOMORROW试验中接受了尼替尼布或安慰剂,然后是吡非尼酮,但他的肺功能仍缓慢下降。由于冠状动脉疾病和肥胖,肺移植未被考虑。确诊52个月后,他还活着。他的母亲80岁了,不吸烟。她的肺纤维化CT显示为UIP型自身免疫性肝炎自身免疫性肝炎的诊断通过细胞溶解、自身抗体(抗rnp、抗平滑肌和抗核)和多克隆高γ球蛋白血症的存在得到证实。她接受了硫唑嘌呤治疗,没有出现细胞减少,但肺功能缓慢下降,直到诊断后最后64个月的随访。 Neither the mother nor the two daughters of the proband, who all carried the mutation, presented skeletal abnormalities.
RTEL1突变对蛋白质结构和功能的影响
RTEL1属于SF2 DEAH亚科包括XPD内铁 - 硫簇的含-DNA解旋酶(着色性干皮)的子类,FANCJ(Fanconi贫血症)和ChlR1(华沙断裂综合征)39.-42.].该系列的所有蛋白质共同是四个域的N-末端RAD3相关DNA螺旋糖核心(两个RECA样电机结构域;螺旋酶域(HD)1和HD2; 4FE-4S集群;和ARCH域)(图3a).这个催化核心之后是rtel1特定的c端区域,该区域包含串联的类似harmonin的结构域,可能在与尚未识别的伙伴相互作用中发挥关键作用[43.]以及一个戒指手指结构域,其可能具有泛素连接酶活性[22.].此外,C-末端延伸含有一种增殖细胞核抗原(PCNA)相互作用基序(PCNA)相互作用主题(PIP盒),RTE1与替换物联系起来[44.].
两个描述的坏人RTEL1.突变位于与rad3相关的DNA解旋酶核心,第三个位于第一个harmonin-like域(图3a).
p.Phe964 (p.F964)属于第一个类琴域的第五α螺旋(图3b)。它对应于邻喹氏域的高度保守的位置,其总是由芳族氨基酸(苯丙氨酸或酪氨酸[)占据[29.])。由于结构原因,它是保守的,因为它的侧链埋在域的核心内。该芳香族氨基酸被亮氨酸(p.F964L)取代后,即使没有失去疏水特性,也会直接影响其折叠或折叠稳定性。在一HH患者中报道了p.(Phe964Leu)突变,显示其对RTEL1功能的有害影响[30.].
P.Thr49(第49页)属于HD1内的保守螺旋酶主题I(Walker A)(图3C和D.).这个氨基酸位于镁离子附近的ATP结合袋内,p.K48下游的一个氨基酸,与ATP γ-磷酸盐结合。因此,p.T49M突变可能会破坏解旋酶结构域的催化活性。
P.Arg213(P.R213)位于螺旋α8内的4FE-4S簇的末端。在税收的晶体结构中,该基本残留物(对应于P.170K)预计与硫酸盐分子形成氢键,以及保守的P.Y209和P.R141(P.Y166和P.R88)在税收中)。如我们3D RTEL1催化核心的模型所观察到(图3.C和E),P.R213与P.Y209和P.R141一起占据由拱形域,HD1和FE-S域产生的孔隙的基本凹槽内的临界位置,提出成为易位DNA的路径的一部分[27.].税前p.k170a突变与DNA结合中的大量减少(〜30倍)有关,即使排除误折叠的人工制品也被排除出来[28.].这一发现表明,RTEL1中的p.R123在单链DNA所遵循的路径中起着积极的作用,单链DNA从一个裂隙延伸到孔出口的整个蛋白质长度[28.].
患者DII.1携带突变导致架空和过早止芯密码子(P.GLN1165PROFS * 22)。该突变导致截断的RTEL1蛋白表达缺乏PIP盒和环形手指结构域的蛋白质[22.].虽然该环结构域的功能仍然未知,但该结构域的纯合子取代突变导致HH综合征,证明其与RTEL1活动的相关性[33.].在RTEL1-PCNA相互作用中断的小鼠细胞中,PIP盒的重要性已经被加速衰老、复制叉不稳定、复制叉延伸率降低和起源使用增加(PIP突变体)所证明[44.].
总体上,结构分析支持RTEL1.在FPF患者中鉴定的突变强烈影响蛋白质的功能和/或稳定性。
讨论
我们在47名患者的队列中进行了WES分析,从35名家庭患有未解释的家族性FPF,发现了4个(11%)的35个家庭中的杂合RTEL1.突变。四四RTEL1.预计FPF患者中鉴定的突变对蛋白质的功能和/或稳定性非常有害。实际上,一个突变导致框架和过早的止芯密码子,另外三个改变蛋白质的功能结构域中的高度保守的残留物。在两个FPF患者中鉴定的P.(PHE964LEU)突变在来自家庭C的两个FPF患者中均在两个兄弟姐妹的纯合状态下报告了HH综合征[30.],展示其致病性。此外,端粒较短RTEL1.-突变的FPF患者比对照组更明显,这是以前在一些杂合子携带者中观察到的表型RTEL1.HH综合征家族的突变[31.那32.].这一发现证实了RTEL1紧密调节端粒长度[15.那18.], 然后RTEL1.臭氧水能足以导致端粒缩短和倾向于肺病。D.嘉等.[32.]报告的肺纤维化在一个携带杂合的58岁男性中RTEL1.突变和C奥根等.[17.的杂合突变RTEL1.在九个fpf家庭。
在散发性肺纤维化和FPF中一直观察到端粒维持的缺陷。高达25%的IPF患者和40%的FPF患者表现出缩短端粒,只有一半的FPF患者是载体的TERT或者TERC突变[45.那46.];患者短的白细胞端粒与IPF中较差的生存率相关[47.].此外,还有四种基因参与端粒长度调节(TERT那Terc,Tinf2.和DKC1中[7.-10.])已经涉及单身fpf。这些基因主要被鉴定为疑难表症,同性恋症是与短端粒相关的骨髓衰竭的疾病。肺部疾病是在约20%的腹腔病虫病患者中发现[10.那14.].最近,表达缺乏C末端结构域的P53的纯合突变小鼠表现出p53活性增加和下调RTEL1.,患有短端粒,患有障碍性贫血和肺纤维化[48.].我们的研究表明RTEL1.缺乏可以解释未解释的FPF患者的一半,没有鉴定遗传原因。
如端粒酶病所述[49.], 全部RTEL1.-突变的FPF家族在几代人的肺部疾病发病年龄下降(遗传预测)。类似于TERT突变载体,诊断中的中位年龄为57岁,诊断肺纤维化的中位年龄A,C和D(不包括家庭B)为56岁[50.],而散发性IPF患者的平均年龄为65-70岁[1].诊断是在患者比那些来自其他家庭低龄从B家做。它不能排除其他的遗传因素可能会导致早期疾病的发生。例如,digenism解释了一些孟德尔疾病[51.].
有趣的是,六出9例患者是吸烟者和/或暴露于吸入aerocontaminants。暴露于吸烟和纤维化污染物类似的高率据报道,在患者与相关的肺纤维化TERT突变[20.那50.,可损伤肺泡上皮,引起纤维化过程。因此,肺部疾病RTEL1.杂合载体可能由遗传缺陷和诸如吸烟的环境因素的组合产生。
在诊断时,该系列的患者中没有人有与端粒综合征相关的共病TERT那TERC和DKC1中突变携带者,如隐源性肝病、血小板减少、大细胞增多或伴有红斑性角化障碍皮疹的色素沉着皮疹[13.那52.那53.].在家庭D中,我们不能排除肝病与RTEL1缺乏有关。但是,未特别评估早期毛灰色。两名患者在环磷酰胺处理后具有早期可逆的中性粒细胞减少症,而氮嘌呤耐受良好。RTEL1是参与DNA修复的螺旋酶。RTEL1.-有缺陷的小鼠胚胎干细胞对dna改变剂(如甲基甲磺酸和紫外线)表现出更高的敏感性[16.].这些数据提示,某些药物,特别是烷基化剂,应谨慎使用RTEL1.突变。最近报告患者中继发于免疫抑制剂的髓细胞抑制剂TERT或者TERC突变[54.那55.].
3例患者表现为自身免疫性疾病(自身免疫性肝炎和类风湿性关节炎)或结节病,因此排除了特发性间质性肺炎。这可能表明纤维化是单基因缺陷、环境因素和自身免疫性疾病共同作用的结果RTEL1.杂合的运营商。在自身免疫性疾病中,端粒维持相关基因突变是否与肺纤维化的发展有关,尚需进一步研究,因为这一发现可能是偶然的。另外,端粒缩短可能会随着年龄增长而促进自身免疫性疾病的发展[56.].
一个病人有骨骼异常,这可能与RTEL1.突变。据报道,骨质疏松症和骨折坏死与之相关TERT或者DKC.突变[50.那57.].没有描述骨骼表型RTEL1.缺陷型小鼠,尽管纯合突变的小鼠致死[15.].
在本研究中,表型基因型COSTGRATEGATION是完整的。但是,鉴定更多RTEL1.需要携带者来评估肺纤维化的渗透RTEL1.突变载体。渗透可能取决于几个因素,包括环境暴露,如肺纤维化引起的TERT和TERC突变[50.].有趣的是,阿什肯纳齐的家庭犹太祖先的家庭经常发生RTEL1.- 处理HH突变,高频率为1%[33.那58].RTEL1.可以随访这些家庭中的突变载体以确定它们是否有发育早期肺病的风险。尽管有这些局限性,但我们的结果对FPF和HH家族的遗传咨询具有重大影响RTEL1..RTEL1.突变载体可能需要肺部表演员的跟进,并应建议避免所有上述环境暴露。
总之,我们的研究确定了杂合子RTEL1.突变作为一种新的FPF的主要遗传原因,并扩大了RTEL1缺陷的临床谱。与端粒维持有关的基因突变可能占到FPF病例的20-25%。
确认
我们感谢Laurent Abel (Imagine Institute, Paris, France)关于变异分析的建议,Nathalie Moyal-Zaafrani (Service de Génétique, Hôpital Bichat, Paris, France), Grégoire Prévot (Pneumologie, CHU de Toulouse, Toulouse, France)和Réza Azarian (Pneumologie, Hôpital Mignot, Le Chesnay,(法国)收集病人的临床图表。
脚注
有关编辑评论,请参阅欧元和J2015;46:312-314 [DOI:10.1183 / 13993003.00710-2015]
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支持声明:这项工作(外显子组测序)得到了Université巴黎索邦大学Cité和巴黎总理府Universités de巴黎总理府(legs Poix)的“FPI-SPC”拨款的支持。P. Revy和I. Callebaut得到了INSERM、法国国家癌症防治协会(Equipe Labellisée La Ligue)、INCa/Cancéropôle法兰西岛、Institut Imagine和欧洲研究理事会的机构资助(PIDIMMUN资助号249816)。P. Revy是国家科学研究中心(CNRS)的科学家。
利益冲突:可以在本文的在线版本旁找到披露www.qdcxjkg.com
- 已收到2015年3月12日。
- 公认2015年4月11日。
- 版权所有©2015