文摘
背景:细菌病原体的诊断下呼吸道感染(爱丽丝)利用传统文化的方法仍然具有挑战性和耗时。
目的:评估快速检测的纳米孔测序基因变体患者下呼吸道感染的致病菌。
方法:我们发起了一项单中心前瞻性队列研究,招收了292名连续住院患者爱丽丝从2018年11月到2019年6月。纳米孔宏基因组测序结果与常规的微生物学试验相比,和不和谐的结果进一步验证了实时PCR。然后,纳米孔测序数据进行评估,两位高级临床医师对病人的病历的临床相关性。
结果:本研究了病人的ICU在1:1的比例和普通病房,收集了171支气管肺泡灌洗液(BALF)和121份痰液样本,并研究了6种疾病。与文化和qPCR测试相比,纳米孔测序取得总体敏感性为96.6%,特异性为88.0%。此外,纳米孔宏基因组鉴定病原体在63年从161年culture-negative样本,和50(79.4%)的样品被成功验证。通过改善考究和厌氧生物物种的识别速度,纳米孔宏基因组显著证明,厌氧生物物种丰富患者肺部脓肿。
结论:纳米孔宏基因组测序可以迅速识别细菌病原体和医学检查证明有价值的调整可以使结果及时向医生报告。
脚注
本文引用:欧洲呼吸杂志2020;56:5。64年,4935年。
这个抽象是2020人队国际大会,在会议“呼吸道病毒的“pre COVID-19“时代”。
这是一个人国际大会抽象。没有全文版本是可用的。进一步的材料来陪这个抽象可能可用www.ers-education.org(人队成员访问)。
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