摘要
背景:大环内酯类抗生素越来越多地用于慢性呼吸系统疾病(CRD)的频繁加重者,但气道耐药体的作用及其与宿主微生物群的关系尚不清楚。
方法:我们从患有和不患有CRD(重度哮喘、慢性阻塞性肺病和支气管扩张)个体的气道标本中,使用深度测序宏基因组方法获得了气道微生物群和相应的阻力体(n=85)。基因-微生物关联网络建立使用组合校正一般增强线性模型,以确定可能的微生物来源的气道阻力体。
结果:在健康和疾病状态中,抗生素耐药性表现出多样性,在COPD和支气管扩张中观察到最大的耐药性。一个以大环内酯耐药为主,但β-内酰胺、氟喹诺酮和四环素耐药基因高流行率的“核心”气道耐药体存在,并且与疾病状态或先前抗生素暴露无关。呼吸微生物群的失调在crd和“核心”抵抗体的基因-微生物关联网络中是明显的链球菌和放线菌作为大环内酯耐药的潜在微生物宿主,包括ermX,ermF和排列基因。
结论:气道功能宏基因组学揭示了宿主微生物群所携带的核心大环内酯耐药体,对大环内酯在CRD中的应用具有临床意义。
资助:新加坡卫生部国家医学研究理事会过渡奖(NMRC/TA/0048/2016) (S.H.C);临床医生-科学家个人研究基金(MOH-000141) (S.H.C)和南大综合医学、生物和环境生命科学(NIMBELS) [NIM/03/2018] (S.H.C)。
脚注
引用这篇文章为:欧洲呼吸杂志2020;56:补充64,4934。
这篇摘要是在2020年ERS国际大会“前COVID-19”时代的呼吸道病毒”会议上发表的。
这是ERS国际大会的摘要。没有全文版本。本摘要的进一步资料可在以下网站获得www.ers-education.org(仅供ERS成员访问)。
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