抽象
理由:PAP是一种超罕见的疾病,其中肺泡空间中的表面活性剂的积累可导致呼吸衰竭而死亡。WLL是目前的标准治疗PAP,治疗后仍持续存在的疾病在30%的病例报道。
目标:这项工作的目的是确定一个共同的基因共表达网络能够预测WLL的结果:总分辨率/持续改进VS瞬时分辨率/逐步恶化。
方法:我们采用了加权的基因共表达网络分析总RNA的转录概况,从谁接受WLL 16名PAP患者外周血单核细胞(PBMC)收集。24个月的随访后,他们在积极VS消极的结果和微阵列分析对分,大约有20000个基因筛选(G3的SurePrint人类基因,安捷伦)进行。最后是为差异表达基因(DEGS)进行基因本体(GO),Reactome,KEGG和疾病本体富集分析。
结果:高度连接基因的四个生物学意义的模块进行鉴定。特别地,这些(理解111个基因与p值<0.05)中的一个可以预测WLL的临床结果。该模块的功能和途径富集分析表明GO途径的优势:分子功能,生物过程和细胞组分。具体地,钙调磷酸酶/ NFAT信号转导途径似乎与到WLL的积极响应相关联。
结论:这是第一次我们提供PAP的模块化轮廓这可以解释的调控机制的临床结果根本。
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