摘要
作品简介:慢性阻塞性肺病和肺纤维化都是与吸烟和衰老相关的疾病,但它们有截然不同的病理特征:慢性阻塞性肺病是由组织破坏引起的,而肺纤维化是由纤维化组织增加引起的。然而,IPF患者也常合并肺纤维化和肺气肿(CPFE),这表明尽管表型非常不同,但在COPD和IPF中可能存在共同的通路。在本研究中,我们使用加权基因连接共识网络分析基因表达,以识别COPD和IPF中存在表达相关的基因群。
方法:我们分析了GEO数据集47460,其中包括105名对照组、211名COPD患者和159名肺组织研究协会收集的IPF患者。将WGCNA一致应用于COPD和IPF样本,以确定相关基因的重叠组。这些模块随后与肺功能(DLCO、FEV1、FVC)相关,并进行多次比较调整。每个模块中与模块和肺功能相关的基因被用来确定GO通路。
结果:共鉴定44个共识模块,其中19个模块与肺功能相关性显著(p<0.05)。在与免疫反应、未折叠蛋白反应、细胞粘附、代谢和发育相关的通路中发现了基因富集。
结论:本研究通过网络分析强调了COPD和IPF中与肺功能下降相关的通路。我们发现COPD和IPF中存在重叠的免疫反应和细胞应激通路,以及与细胞粘附相关的通路的下调。需要进一步确认CPFE肺以确定临床相关性。
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