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随机对照试验
2017 9月15日;196(6):745-755。
doi: 10.1164 / rccm.201610 - 2141摄氏度。

维生素C防止与母亲怀孕期间吸烟有关的子代DNA甲基化变化

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随机对照试验

维生素C防止与母亲怀孕期间吸烟有关的子代DNA甲基化变化

Lyndsey E Shorey-Kendricket al。 J呼吸危重症护理医院
免费PMC文章

摘要

理由是:母亲在怀孕期间吸烟的婴儿,其肺功能会终生下降。在分娩时的胎盘和脐带血中,在胎儿肺中,在儿童时期的颊上皮和血液中,已经描述了与孕妇吸烟相关的DNA甲基化变化。我们在一项随机临床试验(ClinicalTrials.gov标识符,NCT00632476)的研究表明,孕妇吸烟者补充维生素C可以减轻母亲吸烟对后代肺功能的影响,并降低1岁时喘息的发生率。

目的:确定补充维生素C是否能减少因母亲吸烟而引起的子代甲基化变化,以及特定CpGs的甲基化是否也与呼吸结局相关。

方法:对胎盘、脐带血样本和口腔样本进行靶向亚硫酸氢盐测序NCT00632476使用亚硫酸氢盐扩增子测序,对选定的脐带血差异甲基化区域进行独立验证。

测量及主要结果:大多数(69.03%)的CpGs在安慰剂组和非吸烟者组之间至少有10%的甲基化差异,在维生素C治疗后恢复(至少50%)到非吸烟者水平。显著比例的恢复CpGs与表型结果相关,低甲基化CpGs富集程度更高。

结论:我们在多个位点上发现了维生素C补充导致DNA甲基化正常化的模式。这种模式在组织和时间上的一致性表明对后代DNA甲基化有系统性和持续性的影响。需要进一步的工作来确定DNA甲基化的全基因组变化如何介导或反映母亲吸烟对肺功能的持续影响。

关键词:抗坏血酸;哮喘;表观遗传学;尼古丁;产前暴露。

数据

图1所示。
图1所示。
与母亲吸烟相关的靶向位点的DNA甲基化变化被维生素C的补充减弱。热图生成的cpg差异甲基化之间的非吸烟者和安慰剂组成对t测试(名义P≤0.05)。原始甲基化为对数2对每个CpG进行缩放和均值居中以归一化分布,然后进行统计检验(看到颜色键).补充维生素c的吸烟者所生的病人样本(绿色, V1-Vn)靠近非吸烟组别(蓝色的, N1-Nn)比安慰剂组(红色的, P1-Pn) in (一个胎盘,(B)脐带血,及(C)颊上皮。
图2。
图2。
维生素C治疗在靶向位点上逆转了大多数与母亲吸烟相关的显著DNA甲基化变化。点表示非吸烟者(N)、安慰剂治疗吸烟者(P)和维生素c补充吸烟者(V)在每个CpG甲基化显著变化时的平均甲基化(≥10%;名义上的P≤0.05)。cpg按母体吸烟的变化方向聚类(HYPER/HYPO)和表示非吸烟者与安慰剂组的每CpG变化方向,以及安慰剂组与维生素C组的平均甲基化。
图3。
图3。
选择与母亲吸烟相关的脐带血差异甲基化区域(DMRs):(一个)矮子相关转录因子1 (RUNX1);(B独立生长因子1转录抑制因子(GFI1);(C芳基烃受体阻遏剂(AHRR);和(D骨形态发生蛋白4 (BMP4).DMRs用comb-p包来识别成对的空间相关的丰富区域P非吸烟者和安慰剂样本之间的值。土地上通过显示非吸烟者(N)、安慰剂(P)和维生素C (V)在每个错误发现率(显著CpG)下的平均甲基化变化,展示整个DMR甲基化变化的总体趋势。在正确的, DMRs按治疗组绘制,其空间方向为基因组,基底位置为甲基化(平均值±SEM)
图4。
图4。
PR包含域8 (PRDM8)通过多个脐带血差异甲基化区(DMRs)进行低甲基化,并被维生素C (VitC)恢复。PRDM8通过meta分析发现,与母亲吸烟相关的低甲基化CpGs与NCT00632476队列中发现的四个区域重叠,与安慰剂组相比,维生素c补充组的吸烟者甲基化显著增加。DMR图(一个- - - - - -D)显示每组脐带血中相对于染色体位置的平均±SEM甲基化。(一个) chr4_81110074_PRDM8;(B) chr4_81111140_PRDM8;(C) chr4_81118138_PRDM8;(D) chr4_81122567_PRDM8。

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