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． 2017年1月19日;376(3):243-253。
doi: 10.1056 / NEJMoa1604544。

南非广泛耐药结核病的传播

Sarita Shah1， 莎拉·奥尔德1， 詹姆斯·C·M·布鲁斯特1， Barun这个1， 纳齐尔·伊斯梅尔1， Pravi Moodley1， Koleka Mlisana1， 萨利姆Allana1， 安吉拉•坎贝尔1， Thuli Mthiyane1， Natashia莫里斯1， 月见草Mpangase1， Hermina van der Meulen1， 沙希德V奥马尔1， 泰勒·S·布朗1， 之一Apurva Narechania1， 埃琳娜Shaskina1， Thandi Kapwata1， 巴里Kreiswirth1， 尼尔·R·甘地1
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南非广泛耐药结核病的传播

Sarita Shahet al。 N英语J医学． ．
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摘要

背景:耐药结核病威胁着世界各地结核病和人类免疫缺陷病毒(艾滋病毒)感染治疗最近取得的进展。广泛耐药结核病在南非广泛流行，自2002年以来病例大幅增加。导致这种迅速增加的因素尚未完全阐明，但需要这些知识来指导公共卫生干预措施。

方法:我们进行了一项前瞻性研究，涉及2011年至2014年间在南非夸祖鲁-纳塔尔省诊断出XDR结核病的404名参与者。通过访谈和医疗记录审查来获取参与者结核病和艾滋病毒感染史、住院史和社交网络的信息。对结核分枝杆菌进行插入序列(IS)6110限制性片段长度多态性分析、靶向基因测序和全基因组测序。我们使用临床和基因型病例定义来计算由于耐多药(MDR)结核病治疗不足(即获得性耐药)引起的XDR结核病例与由于传播(即传播性耐药)引起的XDR结核病例的比例。我们使用社会网络分析来确定传播的社区和医院地点。

结果:在404名参与者中，311名(77%)感染了艾滋病毒;中位CD4+计数为340个细胞/立方毫米(四分位数范围，117至431)。共有280名参与者(69%)从未接受过耐多药结核病治疗。386名参与者的基因型分析显示，323人(84%)属于31个聚类中的1个。2至14名参与者聚集在一起，除了一个212名参与者(55%)携带LAM4/KZN菌株的大型聚集。在404名参与者中有123人(30%)确定了人与人或基于医院的流行病学联系。

结论:在结核病负担高的南非夸祖鲁-纳塔尔省，大多数XDR结核病病例可能是由于传播，而不是由于耐多药结核病治疗不足。这些数据表明，控制耐药结核病的流行需要更加注重阻断传播。(由国家过敏和传染病研究所和其他机构资助。)

数据

图1
图1。南非夸祖鲁-纳塔尔省广泛耐药(XDR)结核病患者的地理空间坐标
面板A显示了所有404名注册参与者的家庭(红点)。面板B显示了参与者在诊断XDR结核病之前或之后入住的53家医院(蓝色方框)。
图2
图2。基于单核苷酸多态性(SNP)的最大似然进化树
分离株按研究鉴定号进行标记，按限制性片段长度多态性(RFLP)组进行颜色编码。单个分离的RFLP组用黑色表示。这棵树的根系是7系的Percy256。L2表示世系2,L4表示世系4。其他缩写(MH, W, AH, BW, BH, GY, CC和HP)表示分离株之间常见的RFLP模式。这些字母是根据第一次看到特定的RFLP模式来分配的(通常比目前的研究早许多年)。蓝色的圆形带表示下面这棵树树枝上的所有分离株都来自谱系4。橙色带表示它下面的分离株属于谱系2。在圆形树的中心，一根大树枝将橙色带以下的所有分离菌与蓝色带以下的分离菌分开。所有分离RFLP组的内部节点都由100个自举复制中的100个支持。 Publicly available sequences (not sequenced for this study) are marked with asterisks. The scale bar indicates the maximum-likelihood estimate of the number of substitutions per site.
图3
图3。家庭和社区中的社交网络，源自基于姓名的人与人之间的联系
图中显示了一个由59名参与者组成的直接人际联系的社交网络。大的黑色圆圈表示研究参与者。小圈表示与会者指定的450名密切接触者。两个大圆圈之间的线表示2名研究参与者，他们彼此称对方为密切接触者。大圆和小圆之间的线表示每个参与者指定的联系人。根据研究参与者报告的结核病史，接触者的圆圈呈阴影状(白色表示以前没有活动性结核病，灰色表示以前有活动性结核病，黑色表示以前有XDR结核病)。补充附录中的图S3A提供了其他详细信息。
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