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ĴAntimicrob Chemother。2014年8月; 69(8):2215-23。DOI:10.1093 / JAC / dku092。电子出版2014 04月07日。

对肠道resistome选择性消化道去污(SDD)的影响。

作者信息

1
医学微生物学,乌德勒支大学医学中心,荷兰乌得勒支系。
2
微生物学,瓦格宁根大学,荷兰瓦赫宁根的实验室。
3
中心生物医学和健康科学研究,药学院和生物分子科学,布莱顿大学,布莱顿,脊椎动物基因组学系英国,德国马普研究所感染生物学,柏林,德国。
4
荷兰瓦赫宁根大学系统和合成生物学,荷兰瓦赫宁根的实验室。
医学生物技术,锡耶纳大学,意大利锡耶纳的部门。
6
中心生物医学和健康科学研究,药学院和生物分子科学,布莱顿大学,布莱顿,英国维多利亚女王医院NHS信托基金会,东格林斯特德,英国。
7
医学微生物学,大学医学中心的乌得勒支,乌得勒支,荷兰w.vanschaik@umcutrecht.nl系。

抽象

目的:

选择性消化道去污(SDD)是危重病人在重症监护病房(ICU),其目的是消灭从口咽部和肠道致病菌,同时保留厌氧菌群,由非吸收抗生素的应用感染的预防措施。选择抗生素耐药菌仍是SDD的主要问题。因此,我们研究了SDD对抗生素抗性基因(即resistome)通过培养无关方法中的储存器中的影响。

方法:

我们在和ICU停留几个宏基因组方法后评估SDD对肠道菌群和resistome在一个单一的ICU患者的影响。我们还通过定量PCR从谁收到SDD增加12名ICU患者确定的纵向收集的样本中两种常见的氨基糖苷类耐药基因的相对丰度。

结果:

患者微生物是在住院期间非常活跃。抗生素抗性基因的丰度SDD在使用期间增加了一倍多,主要是由于氨基糖苷抗性基因6.7倍的增加,特别是APH(2“) - 1b和一个AADE样基因。我们表明,APH(2“) - IB由厌氧肠道共生庇护,并与可移动的遗传因素有关。在12名ICU患者纵向样品中,这两个基因的动力学从〜10(4)倍的增加至〜10(-10)SDD期间折叠在相对丰度减少范围内。

结论:

ICU住院和SDD的同时应用具有很大,但高度个性化,对ICU患者的肠道resistome影响。选择在厌氧共生菌转让的抗生素抗性基因可能会影响抗生素抗性基因转移到条件致病菌的风险。

关键词:

抗生素耐药性;重症监护医学;宏基因组学

结论:
24710024
DOI:
10.1093 / JAC / dku092
[索引为MEDLINE]

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