doi: 10.1371 / journal.pone.0025959。
Epub 2011年10月10日。
机械通气早产儿气管吸出液中细菌的分子鉴定
从属关系
- PMID:22016793
- PMCID:PMC3189942
- DOI:10.1371 / journal.pone.0025959
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机械通气早产儿气管吸出液中细菌的分子鉴定
《公共科学图书馆•综合》．
2011．
免费PMC文章
摘要
背景:尽管有强有力的证据将感染与支气管肺发育不良(BPD)的发病机制联系起来，但细菌培养方法的局限性阻碍了相对于疾病结局的气道生物体的系统研究。分子细菌鉴定策略的应用可能为BPD风险早产儿气道中细菌获得的作用提供新的见解。
方法:采集10例胎龄≤34周、出生体重500-1250 g、需要机械通气至少21天的早产儿连续(72小时、7天、14天、21天内)气管抽吸样本。通过实时荧光定量PCR测定样品的总细菌载量，并通过焦磷酸测序进行细菌鉴定。
结果:受试者被诊断为轻度(1)、中度(3)或重度(5)BPD。一名患者在疾病严重程度确定之前死亡。共分析107487条序列，平均每个样本3359条(范围1724 - 4915)。收集的寿命小于72小时的10个样本中有2个含有足够的细菌DNA，可以成功进行序列分析，其中一个样本来自暴露于绒毛膜羊膜炎的受试者。其余样品均显示细菌载量为>70拷贝/反应。共观察到72种生物。在31/32个阳性序列样本中，7个生物为优势生物(占总序列的> %)。13份样品中优势生物占总序列>的90%。葡萄球菌、尿素脲原体和尿素脲原体是最常见的优势菌，但假单胞菌、肠球菌和埃希氏菌也被发现。
结论:早期不同种类的细菌定植发生在气管插管早产儿出生后3天，可以细菌负荷和显著的物种多样性为特征。对早产儿下气道细菌的分子鉴定有可能进一步深入了解BPD的发病机制。
利益冲突声明
数据
每个样品的细菌组成在柱状图中显示为样品中总序列的百分比。根据图例，每个物种都可以通过颜色来识别。使用抗生素的天数显示在每个图表的顶部，实线描述特定抗生素使用的持续时间，如图右侧所示。临床获得的培养结果显示在每张图的中间部分，用“x”表示获得的日期。除非另有说明，所有培养均来自气管引物。(NG:无生长，MURF:上呼吸道混合菌群，阴沟肠杆菌:肠杆菌属阴沟杆菌，肺炎克雷伯菌:克雷伯氏菌肺炎，MSSA:甲氧西林敏感葡萄球菌的金黄色葡萄球菌，绿脓杆菌假单胞菌绿脓杆菌。
一个。样品总细菌载量的分布情况。线连接每个患者的样本，标记患者编号对应于表1所示的临床数据。B。由香农指数确定的样本生物多样性。线连接每个患者的样本，标记患者编号对应于表1所示的临床数据。
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