多中心研究
doi: 10.1016 / j.jaci.2009.11.018。
哮喘的全基因组关联研究确定了RAD50-IL13和HLA-DR/DQ区域
从属关系
- PMID:20159242
- PMCID:PMC2824608
- DOI:10.1016 / j.jaci.2009.11.018
剪贴板中的项目
多中心研究
哮喘的全基因组关联研究确定了RAD50-IL13和HLA-DR/DQ区域
[J]过敏症临床免疫．
2010年2月．
免费PMC文章
摘要
背景:哮喘是一种异质性疾病，由遗传易感性与环境影响相互作用引起。全基因组关联研究(GWASs)是研究DNA变异与疾病易感性之间关系的有力方法。迄今为止，很少有关于哮喘GWASs的报道。
目的:对一组患有严重或难治性哮喘的患者进行GWAS，以确定与哮喘发病机制有关的基因。
方法:在473例哮喘流行病学和自然史:结局和治疗方案(TENOR)病例和1892例Illumina普通人群对照中，共检测了292443个单核苷酸多态性(snp)与哮喘的相关性。在473例TENOR病例和363例无哮喘病史的表型对照中，还在确定的候选区域检测了哮喘相关的定量性状(血清总IgE、FEV(1)、用力肺活量和FEV(1)/用力肺活量)，以进一步分析GWAS结果。在确定的候选区域进行代入，以进行更密集的SNP覆盖分析。
结果:染色体5q31.1上RAD50- il13区域的多个snp与哮喘相关:RAD50内含子2中的rs2244012 (P = 3.04E-07)。6p21.3染色体上的HLA-DR/DQ区也与哮喘相关:HLA-DQB1 3'非翻译区rs1063355 (P = 9.55E-06)。在RAD50的T(H)2基因座控制区3′处发现了几个显著的snp。代算还发现HLA-DQB1和HLA-DQA2之间存在更显著的SNP rs3998159 (P = 1.45E-06)。
结论:该GWAS在全基因组水平上证实了T(H)2细胞因子和抗原呈递基因在哮喘中的重要作用，以及对这两个区域进行进一步研究以描述其结构复杂性和在哮喘发展中的生物学功能的重要性。
版权所有2010年美国过敏，哮喘和免疫学学会。莫斯比出版公司。版权所有。
数据
在473例TENOR病例和1892例Illumina对照中发现292443个snp全基因组关联。x轴的色阶表示染色体。负对数变换的气相色谱调整的P值显示在y轴上。
14个单核苷酸多态性的连锁不平衡(LD)和关联图H2个细胞因子位点。(A)关联图:负对数变换后的P值(左刻度)和重组率(右刻度)。(B) LD图:r2配色方案被使用和标记。使用D '上的95%置信区间来设置块。
HLA-DR/DQ区10个snp的连锁不平衡(LD)和关联图。(A)关联图:负对数变换后的P值(左刻度)和重组率(右刻度)。(B) LD图:r2配色方案被使用和标记。使用D '上的95%置信区间来设置区块。46个snp中只有10个被显示出来(P≤0.001)。
类似的文章
-
东北汉族RAD50-IL13多态性与儿童哮喘易感性缺乏相关性中华哮喘杂志，2016;53(2):114-8。doi: 10.3109 / 02770903.2015.1067322。Epub 2015年9月12日 [J]哮喘。2016。 PMID:26365633
-
HLA-DQ再次出击:全基因组关联研究进一步证实了HLA-DQ在成人哮喘诊断中的作用。临床实验变态反应。2012,42(12):1724-33。doi: 10.1111 / cea.12000。 临床经验过敏。2012。 PMID:23181788 免费PMC文章。
-
成人哮喘住院的全基因组关联研究[J] .临床过敏症杂志，2013;14(3):933-940。doi: 10.1016 / j.jaci.2020.08.020。Epub 2020 9月2日 [J] .中华过敏症杂志。2016。 PMID:32890573 免费PMC文章。
-
GWAS对HLA和疾病关联有何作用?国际免疫学杂志，2017;44(5):195-211。doi: 10.1111 / iji.12332。 Int J Immunogenet. 2017。 PMID:28877428 审查。
-
发现哮喘相关基因的全基因组关联研究。中华呼吸病学杂志，2011;16(3):396-406。doi: 10.1111 / j.1440-1843.2011.01939.x。 Respirology》2011。 PMID:21276132 审查。
引用的
-
重症儿童哮喘治疗:Dupilumab。儿科前沿。2022年11月22日;10:96 . 3610。doi: 10.3389 / fped.2022.963610。eCollection 2022。 前沿儿科，2022。 PMID:36483465 免费PMC文章。 审查。
-
贝叶斯模型和选择特征分析揭示了犬特应性皮炎的危险因素。生物学报。2022年12月8日;5(1):1348。doi: 10.1038 / s42003 - 022 - 04279 - 8。 公共生物。2022。 PMID:36482174 免费PMC文章。
-
严重但不中度的哮喘患者与创伤后应激障碍和抑郁症有相同的血液转录组变化。科学通报。2022;17(10):e0275864。doi: 10.1371 / journal.pone.0275864。eCollection 2022。 公共科学图书馆。2022。 PMID:36206293 免费PMC文章。
-
白细胞介素基因与约旦斑秃的遗传关系阿曼医学杂志，2022年9月30日;37(5):e421。doi: 10.5001 / omj.2022.92。收集2022年9月 阿曼医学J. 2022。 PMID:36188885 免费PMC文章。
-
Dupilumab(一种白细胞介素4和13的双受体拮抗剂)对重度哮喘的生物治疗。疫苗(巴塞尔)。2022年6月19日;10(6):974。doi: 10.3390 / vaccines10060974。 疫苗(巴塞尔)。2022. PMID:35746582 免费PMC文章。 审查。
