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2008年2月,82(2):501 - 9。
doi: 10.1016 / j.ajhg.2007.10.004。 Epub 2008年1月31日。

TINF2是端粒保护复合物的一个组成部分,在先天性角化不良症中发生突变

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TINF2是端粒保护复合物的一个组成部分,在先天性角化不良症中发生突变

莎伦·A·萨维奇et al。 我是热内吗 2008年2月
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摘要

先天性角化不良(DC)是一种异质性遗传性骨髓衰竭综合征,患者端粒生物学异常,包括端粒非常短和DKC1、TERC、TERT或NOP10的种系突变,但约60%的DC患者缺乏可识别的突变。利用极短的端粒表型和高穿透性的罕见疾病模型,对一个常染色体显性DC家族进行了连锁扫描,DKCI、TERC或TERT无突变。在2p24和14q11.2位点发现了有利于连锁的证据,这导致在先证者及其5个受影响的亲属中鉴定出TINF2 (14q11.2)突变K280E,在另外3个不相关的DC先证者中鉴定出TINF2 R282H,其中一个患有Revesz综合征;第五个DC先证者有R282S突变。TINF2突变在未受影响的亲属、DKC1、TERC或TERT突变的DC先证者或298名对照受试者中不存在。我们证明了第五种基因,TINF2,在经典DC和Revesz综合征中首次发生突变。这代表了第一个与人类疾病相关的遮蔽素复合物突变,并证实了极短端粒作为DC诊断测试的作用。

数据

图1
图1
A家系第二代同卵双胞胎有五个姐妹和三个兄弟。端粒长度在个体上确定,除非用星号表示。
图2
图2
淋巴细胞端粒长度(A)家族A的flow-FISH测量的淋巴细胞端粒长度,包括III代受影响的个体(红色填充方块),III代沉默携带者(红色开放方块),III代未受影响的成员(蓝色填充方块),以及I代和II代未受影响的成员(蓝色开放方块)。黑线表示第一个百分位数,蓝线表示第99个百分位数。个体III-05(第一个百分位线上的红色方框填充)的端粒长度为5.2 kb。年龄的第一个百分位数是5 kb。然而,他的端粒长度小于幼稚T细胞和粒细胞年龄的第一个百分位(数据未显示)。(B)四个不相关的DC先证物(红色圆圈填充)的淋巴细胞端粒长度TINF2突变、未受影响的亲本(打开的蓝钻)和未受影响的兄弟姐妹(填充的蓝钻)。
图3
图3
2号染色体和14号染色体的LOD评分是在常染色体显性(参数)下确定的,罕见疾病模型,端粒长度小于第一个百分位,作为文本中描述的受影响的表型。标记的相对位置被标记在x轴上。(上)去除连锁不平衡的SNP后,对2号染色体上的356个SNP标记进行了评估。LOD评分最大值为2.62,分别位于2号染色体上3.5 Mb和21.1 Mb的SNP标记rs6767和rs520354之间。DDX1是这个位置的最佳候选基因。(下)去除连锁不平衡的SNP后,对14号染色体上的161个SNP标记进行了评估。LOD评分最大值为2.62,分别位于14号染色体22.4 Mb和25.2 Mb位置的SNP标记rs1570342和rs195677之间。TINF2是这个位置的最佳候选基因。
图4
图4
的代表性序列跟踪TINF2先证者和突变在序列追踪上面被注意到。
图5
图5
基因组结构与进化保护TINF2(A)的基因组区域TINF2由2686个碱基对组成。红色箭头表示本研究在DC患者中发现的突变的相对位置,Ex6+234A→G (K280E)、Ex6+240C→A (R282S)和Ex6+241G→A (R282H)。显示人类和小鼠基因组序列守恒的曲线是用VISTA生成的。在右边,50%和75%的保护被注意到。外显子用蓝色表示,保守的3 '未翻译区域用浅蓝色表示。(B)核苷酸守恒的比较智人(Entrez基因注释,NC_000014.7),黑猩猩(NC_006481.2),亩骶(NC_00080.5),鼠形(NC_005114.2),犬类狼疮(NC_006590.2),(NC_007308.2)TINF2Ex6+204到Ex6+272之间的基因组序列。保守的核苷酸用黄色表示。红色箭头表示突变的核苷酸。核苷酸上方的蓝线表示假定的外显子剪接增强子(ESE)序列。(三)氨基酸守恒比较智人(Entrez Protein Annotation, NP_036593.1),黑猩猩(CAH89509.1,假设蛋白TIN2),亩骶(NP_663751.2),鼠形(NP_001006963.1),犬类狼疮(XP_850486.1,预测蛋白),以及(XP_593926.3,预测蛋白)之间的氨基酸270和292。保守的氨基酸以黄色表示。突变的氨基酸K280E, R282S和R292H在底部。

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