疟疾

图1

图1．A)疟疾、B)艾滋病毒/艾滋病和C)结核病疾病传播和进展模型的健康状态过渡图。T，患者接受治疗;NT，未提供治疗;TF，治疗失败还是…

为了评估疟疾的死亡率，我们开发了一种模型（图1该研究使用马尔可夫模型，以8天时间步长预测疟疾对5岁以下儿童的影响。8天的时间步长相当于儿童疟疾发作的平均持续时间(28.）.我们的模型跟踪4种健康状态:未感染、感染无并发症症状疟疾、感染严重疟疾和死亡。根据感染、治疗或疾病进展的时间依赖概率，人们可以在特定的时间范围内转变这些健康状态。我们使用年龄特异性感染概率来解释自然获得免疫(29.）.在感染后，儿童转变为不复杂的疟疾的健康状况，他们可以从中恢复，对严重疟疾进行进展，或者从感染中取死。同样，严重疟疾的儿童可以恢复或死亡。为简单起见，我们假设严重的疟疾只能作为从简单的疟疾的渐进状态发生。恢复和死亡的概率取决于疟疾是否无论是否严重，以及儿童是否接受治疗。

在撒哈拉以南非洲，大多数未复杂的疟疾病例是根据症状而不是阳性测试或正式的医疗诊断治疗，并且从当地商店或药房购买治疗药物（30.）.因此，我们保守地认为，埃博拉疫情造成的卫生服务中断只影响严重疟疾的治疗。

艾滋病毒/艾滋病

我们开发了一个决策树模型，以估算降低的抗逆转录病毒治疗（ART）对几内亚，利比里亚和塞拉利昂的艾滋病毒/艾滋病相关死亡的影响（图1，面板b）。我们测量了艾滋病毒/艾滋病死亡率在15-49岁的艾滋病毒/艾滋病感染者中相关死亡的条款。我们考虑了CD4计数的两个分布（> 500，350-500，200-349，<200个细胞/毫米^3.），并且依赖于没有艺术，艺术失败和接受艺术的染色的CD4的CD4计数（技术阑尾表1）.继谁在相关时间段（2013-2015）期间对艺术启动进行了建议，我们认为，除非其CD4计数<500细胞/ mm，否则人们没有启动艺术^3.（31）.我们没有纳入艾滋病毒进展，因为与感兴趣的时间框架相比，进展速度缓慢（32）.

结核

我们开发了一个决策树模型来估计治疗覆盖对在整个埃博拉疫情的突突发中的TB负担（塞拉利昂）对TB负担的影响（图1，小组c）。我们在埃博拉疫情开始时专注于有活跃的TB的人。我们区分了药物易感Tb的感染和多药TB的感染（MDR TB）。我们假设没有治疗，感染DS-TB的人将自然恢复，仍然用药物易感TB感染，或者根据临床研究结果以速率死亡。假设MDR结核病病例患者在埃博拉疫情的过程中仍然留在感染或死于感染。

我们假设与药物敏感结核病是人谁接受治疗既可以成功地治疗，未成功处理，并保持活着，或者死。这些谁经历治疗失败或服用完整疗程之前中断治疗可发展为耐多药结核病，然后可以寻求治疗耐多药结核病。我们假定谁感染了耐多药结核病的埃博拉仍将感染或如果他们不处理我们分析的9个月的时间范围内死亡的启动者。由于耐多药结核病的治疗需要24个月（33），我们认为，无论它们是否仍被感染或退还潜在结核病，我们都假定接受治疗的人将在整个9个月内保持治疗。

模型校准

我们将该模型参数化，分布了流行病学参数的价值观和来自公开文献的人口 - 风险估计数（表1;技术阑尾表1那2）.我们由埃博拉爆发前与几内亚，利比里亚和塞拉利昂疾病研究的2013全球疾病负担的估计比较每年死亡校准我们的模型（5.那24.）.每个输入参数分布进行取样5000次。被选定为我们的不确定性分析其死亡数下降了疾病研究的全球疾病负担的95％CI内的样品（表2.）.模型迭代模拟了5 000人的所有疾病的疾病和治疗事件，共实现了2 500万次。在我们的模型中，几内亚的疟疾发作发生率为0.3 (95% CI 0.1-0.6)发作/人年，利比里亚为0.3 (95% CI 0.1-0.6)发作/人年，塞拉利昂为0.3 (95% CI 0.2-0.5)发作/人年，与西非的经验估计相符(29.）.在埃博拉疫情爆发期间关于减少常规医疗保健服务和获取豚鼠和塞拉利昂治疗的报告（1)，我们在基本病例分析中考虑减少50%的疟疾、艾滋病毒/艾滋病和结核病治疗。

多因素敏感性分析

为了评估每个流行病学参数对埃博拉相对超额死亡的影响，我们使用偏秩相关系数(partial rank correlation coefficient, PRCC)进行了多元敏感性分析。PRCC度量输入参数与输出变量之间的单调关联强度(28.）.在该PRCC越大，越坚固模型参数对死亡率从关注疾病的影响：疟疾，艾滋病毒/艾滋病，结核病或。

疟疾

我们估计，在埃博拉爆发期间，如果治疗覆盖率降低50%，将导致几内亚12,825 (95% CI 4,845-21,945)以下5岁儿童因疟疾死亡，利比里亚2,573 (95% CI 735-5,040)和塞拉利昂4,860 (95% CI 2,700-9,450)儿童死亡。我们估计，几内亚的疟疾死亡率增加了48.0% (95% CI 4.9%-93.8%)，利比里亚增加了53.6% (95% CI 4.8%-145.5%)，塞拉利昂增加了50.0% (95% CI 5.0%-118.8%)。这一增加意味着几内亚增加了4,275人(95%置信区间570-9,405)，利比里亚增加了788人(95%置信区间105-1,890)，塞拉利昂增加了1,755人(95%置信区间135-2,970)(表3）.

艾滋病毒/艾滋病

在埃博拉疫情期间，鉴定了50％的艺术覆盖率减少，我们估计5,151（95％CI 3,099-7,333）的年龄将在利比里亚的1,198（95％CI 851-1,841）中死亡塞拉利昂2,621（95％CI 1,390-4,183）。占据艺术覆盖率减少的艾滋病毒/艾滋病死亡的增加估计在几内亚的16.2％（95％CI 1.3％-30.2％），13.0％（95％CI 2.6％-25.4％），13.0％（95％CI 2.6％-25.4％），9.1塞拉利昂％（95％CI 1.6％-19.1％）。这种增加代表了来自利比里亚的豚鼠，155（95％CI 23-297）的713（95％CI 58-1,528），塞拉利昂（323）（95％）（95％）（95％CI 29-504）（表3）.

结核

如果将药物敏感和耐多药结核病的治疗覆盖率降低50%，我们估计几内亚将有3,463人(95%置信区间2,808-4,349)死于结核病，利比里亚将有1,553人(95%置信区间1,216-1,875)死于结核病，塞拉利昂将有2,164人(95%置信区间1,815-2,548)死于结核病。据估计，几内亚51.1% (95% CI 44.7%-70.5%)，利比里亚59% (95% CI 47.9%-77.4%)，塞拉利昂61.4% (95% CI 49.2%-87.6%)。这一增加意味着几内亚增加了1281例(95%置信区间877 - 1474)，利比里亚增加了592例(95%置信区间394-691)，塞拉利昂增加了841例(95%置信区间680 - 1010)(表3）.

变异治疗覆盖率

我们通过在麦芽糖爆发之前，在麦芽糖，利比里亚和塞拉利昂的艾博兰疫情爆发之前的10％-90％的水平范围内的10％-90％的水平范围内减少了敏感性分析。由于治疗覆盖范围有所不同，据估计豚鼠爆发的额外死亡额外的死亡均可从1,425-8,336次因疟疾，146-1,237例艾滋病毒/艾滋病，277-2,317种变化。在利比里亚，归属于艾博拉疫情的额外死亡，从210-1,502种，疟疾，50-314用于艾滋病毒/艾滋病，100-987型TB。塞拉利昂的额外死亡计数从630-3,172的疟疾，70-630用于艾滋病毒/艾滋病，143-1,723为TB。

图2

图2．在应对2014-2015年西非埃博拉疫情期间，模型结果对治疗覆盖率变化的敏感性分析。A)几内亚，B)利比里亚，C)塞拉利昂，D)所有三个…

我们估计，如果几内亚的治疗覆盖率降低15%，与埃博拉相关的疟疾、艾滋病毒/艾滋病和结核病间接死亡人数将超过截至2015年3月8日几内亚报告的累计2170名埃博拉死亡人数(图2， A栏)(34）.在利比里亚，报4,162直接死于埃博拉病毒（34）可能大于其对疟疾，艾滋病毒/艾滋病和结核病的间接影响（图2，面板b）。在塞拉利昂，减少治疗覆盖率>65％导致疟疾，艾滋病毒/艾滋病和TB的间接死亡数量高于埃博拉（埃博拉）的3,629名直接死亡（图2， C栏)(34）.总体而言，在西非研究的3个国家，治疗覆盖率的减少50％导致埃博拉的直接死亡较高的间接死亡（图2，小组d）。

多因素敏感性分析

我们的PRCC分析表明，从严重疟疾中死亡的概率与疾病和不接受治疗的概率，从未复杂到严重疟疾的概率，在不接受治疗的情况下从不复杂的疟疾中死亡的可能性，以及发烧发烧疟疾的儿童的可能性对这3个国家的埃博拉遗嘱占患有额外疟疾死亡的影响最大（表4.）.我们发现埃博拉疫情之前的艺术覆盖率以及与CD4计数<200个细胞/ mm的人的人进行了染色的概率^3.在决定埃博拉遗传额外的艾滋病毒/艾滋病死亡人数（表4.）.类似地，治疗覆盖率为TB埃博拉爆发前被认为是在确定与TB相关的死亡（主要参数表4.）.