摘要
尽管早期肺癌生存率的预后基因表达特征已被提出,但对于临床应用而言,确定其在不同受试者人群和不同实验室中的表现至关重要。在此,我们报道了一项基于442例肺腺癌基因表达的几种预后模型的性能的大型训练-测试、多位点、盲法验证研究。提出的假设检查了基因表达的微阵列测量是否单独或结合基本的临床协变量(分期、年龄、性别)可以用来预测肺癌受试者的总生存率。几个模型检查产生的风险评分与实际受试者结果有很大的相关性。大多数方法结合临床数据表现更好,支持在建立早期肺癌预后模型时结合使用临床和分子信息。这项研究还提供了肺腺癌广泛的病理和临床注释的最大可用的微阵列数据集。
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确认
我们感谢M. Orringer、A. Pickens、F. Taylor、N. Liu、D. Lau、M. Whitehead、L. Chen、L. Vargas、Y. Xiao、M. Maddaus和C. huang。我们感谢来自美国国家癌症研究所生物信息学中心的M. Heiskanen、L. Liu、D. Reeves和S. Whitley以及来自信息管理服务中心的W. Ricker对肺研究数据库开发和数据管理的帮助。我们感谢杜克大学癌症和白血病B组统计中心的D. Sawyer、J.M. Askew和A. Vaughn对临床数据的质量控制。我们感谢Affymetrix的技术支持。这项工作得到了美国国家癌症研究所CA84953, CA84999, CA84995, CA85052和CA46592的资助,合同263-MQ-319735, 263-MQ-319740, 263-MQ-319746和263-MQ-510430,并得到了加拿大癌症协会的支持。
作者信息
从属关系
财团
贡献
编写委员会:k.s., j.m.g.t., s.a.e., m.s.t., t.j.y., w.l.g., s.e., i.j., v.e.s., m.m., r.k., k.k.d., t.l., J.W.J.和D.G.B.写作委员会的成员参与了该项目的策划、启动、数据生成、数据分析和稿件准备。
额外的参与者:t.j.g.、d.e.m.、A.C.C.和S.H.在密歇根大学参与了样本收集和准备、数据生成和数据分析等方面的工作。C.Q.Z、d.s.、f.a.s.、K.D.和L.S.参与了安大略癌症研究所的样本收集和制备、数据生成和数据分析等方面的工作。K.N, N.P, B.W, R.V, c.l.a和T.G.在Dana-Farber癌症研究所和Broad研究所参与了样本收集和制备、数据生成和数据分析等方面的工作。M.G.收集了h·李·莫菲特癌症中心的临床数据。j.s., M.Z, v.r., m.k., a.v., n.m., W.T.和A.S.参与了纪念斯隆-凯特琳癌症中心的样本收集和制备,数据生成和数据分析等方面的工作。b.c参与了这项研究的规划和启动。
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额外的信息
该联盟由写作委员会和其他参与者组成,详见作者贡献部分。
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关于本文
引用本文
肺腺癌分子分类主任挑战联盟。基于基因表达的肺腺癌生存预测:一项多位点、盲法验证研究。Nat地中海14,822 - 827(2008)。https://doi.org/10.1038/nm.1790
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DOI:https://doi.org/10.1038/nm.1790
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