摘要
结节病是一种复杂的慢性炎症性疾病,主要表现在肺部。在该疾病的首次全基因组关联研究(>44万个SNPs)中,我们检测到一系列的遗传关联,该研究包括499名患有结节病的德国个体和490名对照。最强的关联信号映射到ANXA11染色体10q22.3上的(膜联蛋白A11)基因。独立样本(1649例,1832例对照)验证证实了相关性(SNP rs2789679:P= 3.0 × 10−13rs7091565:P= 1.0 × 10−5allele-based测试)。广泛的精细定位将关联信号定位到第5外显子和第14外显子之间的区域ANXA11.一个常见的非同义SNP(rs1049550,C> T,R230C)被发现与结节病强烈相关联。该GWAS导致SNP,并分别与rs1049550强烈连锁不平衡的区域(rs1953600,rs2573346,rs2784773)的额外风险的变体。膜联蛋白A11具有几种生物途径,包括细胞凋亡与增殖复杂和基本功能。
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2009年3月24日
注:在本文的最初版本发布,该SNP在抽象rs1049550列出被错误地表示为T>碳变化。这是一个C> T改变。在文章的第三页,包含rs1049550单倍型被错误地列为TATACC。它应该是AGCATT。这些错误已经在文章的HTML和PDF版本中得到纠正。
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致谢
作者要感谢所有个人结节病,家人和医生的合作。德国结节病患者组织(德国Sarkoidose-Vereinigung)和肺专科医师的贡献的努力表示感谢。作者要感谢T. Wienker,M.斯蒂芬斯,M.阿尔布雷希特,T Wesse和C.冯明镜Lanken专家的技术帮助,R. Kleindorp和G.里希特后勤帮助,R.沃格勒数据库和计算机支持。这项研究是由德国国家基因组研究网络(NGFN-2)的资助。
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贡献
S.H。进行SNP选择,基因分型和数据分析,起草的手稿和制备的表和图中的部分;A.Franke和A.Fischer帮助数据分析,并有助于设计和稿件的撰写;G.J.和P.R.执行的蛋白,免疫组织化学和cDNA的实验和促成了原稿;M.K.监督统计分析和编辑的纸;M.N.进行单倍型分析,并与数据分析帮助;多发性硬化症。 and J.M.-Q. coordinated the recruitment, collected the phenotype data and contributed to the writing of the manuscript; K.I.G. provided the bronchoalveolar lavage and transbronchial biopsy samples; S.H. and S.S. jointly designed and supervised the experiment and wrote the manuscript.
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霍夫曼,S.,弗兰克,A.,费,A.et al。全基因组关联研究确定ANXA11作为结节病新的易感位点。Nat麝猫40岁,1103 - 1106(2008)。https://doi.org/10.1038/ng.198
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