用深度神经网络对皮肤癌进行皮肤科医生级别的分类gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba应改正的错误gydF4y2Ba本文发表于2017年6月29日gydF4y2Ba

摘要gydF4y2Ba

皮肤癌是人类最常见的恶性肿瘤gydF4y2Ba1gydF4y2Ba,gydF4y2Ba2gydF4y2Ba,gydF4y2Ba3.gydF4y2Ba首先是视觉诊断,首先是初步的临床筛查,然后可能是皮肤镜分析、活组织检查和组织病理学检查。使用图像对皮肤病变进行自动分类是一项具有挑战性的任务,因为皮肤病变外观的细粒度变异性。深度卷积神经网络(CNNs)gydF4y2Ba4gydF4y2Ba,gydF4y2Ba5gydF4y2Ba展示跨许多细粒度对象类别的通用和高度可变任务的潜力gydF4y2Ba6gydF4y2Ba,gydF4y2Ba7gydF4y2Ba,gydF4y2Ba8gydF4y2Ba,gydF4y2Ba9gydF4y2Ba,gydF4y2Ba10gydF4y2Ba,gydF4y2Ba11gydF4y2Ba.在这里,我们演示了使用单一CNN对皮肤病变进行分类,直接从图像端到端进行训练,只使用像素和疾病标签作为输入。我们使用129,450张临床图像的数据集训练CNN——比之前的数据集大两个数量级gydF4y2Ba12gydF4y2Ba-由2032种不同的疾病组成。我们对21名经委员会认证的皮肤科医生在活检证实的临床图像上的表现进行了测试,有两个关键的二元分类用例:角化细胞癌和良性脂溢性角化病;恶性黑素瘤和良性痣的对比。第一个病例表明确定了最常见的癌症,第二个病例表明确定了最致命的皮肤癌。CNN在这两项任务中的表现与所有接受测试的专家相当,证明了人工智能在皮肤癌分类方面的能力与皮肤科医生相当。配备了深度神经网络的移动设备可能会扩大皮肤科医生在诊所之外的覆盖面。据预测,到2021年,智能手机用户将达到63亿。gydF4y2Ba13gydF4y2Ba),因此有可能提供低成本的重要诊断服务的普及。gydF4y2Ba

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图1:深度CNN布局。gydF4y2Ba
图2:分类和示例测试集图像的示意图。gydF4y2Ba
图3:CNN和皮肤科医生的皮肤癌分类表现。gydF4y2Ba
图4:CNN中四个疾病类别的最后一个隐藏层表示的t-SNE可视化。gydF4y2Ba

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下载参考gydF4y2Ba

确认gydF4y2Ba

我们感谢Thrun实验室的支持和想法。我们感谢斯坦福大学、宾夕法尼亚大学、麻省总医院和爱荷华大学皮肤科的成员完成了我们的测试。这项研究得到了Baxter基金会和h.m.b的资助。此外,这项工作还得到了美国国立卫生研究院(NIH)国家促进转化科学临床和转化科学中心奖(UL1 TR001085)的支持。内容仅由作者负责,不一定代表NIH的官方观点。gydF4y2Ba

作者信息gydF4y2Ba

从属关系gydF4y2Ba

作者gydF4y2Ba

贡献gydF4y2Ba

A.E.和B.K.对算法进行了概念化和训练,并收集了数据。R.A.N, j.k k和S.S.开发了分类法,监督了医疗任务并招募了皮肤科医生。H.M.B.和S.T.监督了这个项目。gydF4y2Ba

相应的作者gydF4y2Ba

对应到gydF4y2Ba安德烈EstevagydF4y2Ba或gydF4y2Ba布雷特KuprelgydF4y2Ba或gydF4y2Ba罗伯托·a·诺沃亚gydF4y2Ba或gydF4y2BaSebastian ThrungydF4y2Ba.gydF4y2Ba

道德声明gydF4y2Ba

相互竞争的利益gydF4y2Ba

作者声明没有竞争的经济利益。gydF4y2Ba

额外的信息gydF4y2Ba

审核人信息gydF4y2Ba

自然gydF4y2Ba感谢A. Halpern, G. Merlino和M. Welling对这项工作的同行评审所做的贡献。gydF4y2Ba

扩展的数据图和表gydF4y2Ba

图1从训练类概率计算推理类概率的过程。gydF4y2Ba

使用分类法和模拟训练/推理类的子集的推理过程的说明性示例。推断类(例如,恶性和良性病变)对应于树中的红节点。训练类(例如,无色素黑色素瘤、蓝色痣)是使用maxClassSize = 1000的划分算法确定的,对应于树中的绿色节点。白色节点表示祖先节点的训练类中包含的节点,或者表示节点太大而不能作为单独的训练类的节点。这个方程表示父节点的概率,gydF4y2BaugydF4y2Ba,以及它的后代,gydF4y2BaCgydF4y2Ba(gydF4y2BaugydF4y2Ba);子概率的和等于父概率的和。CNN在训练节点上输出一个分布。因此,要恢复任何推理节点的概率,只需将其子节点的训练节点的概率相加。给出了良性推理类的一个数值例子:gydF4y2BaPgydF4y2Ba良性的gydF4y2Ba= 0.6 = 0.1 + 0.05 + 0.05 + 0.3 + 0.02 + 0.03 + 0.05。gydF4y2Ba

图2 CNN与皮肤科医生的混淆矩阵比较。gydF4y2Ba

对于第二种验证策略的九种分类任务,CNN和两位皮肤科医生的混淆矩阵揭示了人类专家和CNN在错误分类方面的相似性。元素(gydF4y2Ba我gydF4y2Ba,gydF4y2BajgydF4y2Ba)表示预测类的经验概率gydF4y2BajgydF4y2Ba考虑到基本事实是阶级gydF4y2Ba我gydF4y2Ba,gydF4y2Ba我gydF4y2Ba而且gydF4y2BajgydF4y2Ba引用中的类gydF4y2Ba扩展数据表2dgydF4y2Ba.值得注意的是,CNN和皮肤科医生明显混淆了良性和恶性的黑素细胞病变(7级和8级),皮肤科医生在预测恶性方面犯了错误。在所有三个图中,炎性病变在第6列的分布都很明显,表明许多病变很容易与这一类混淆。在所有三个图的第2行分布显示了恶性真皮肿瘤的分类困难,它表现为皮肤下的皮肤结节。每个皮肤科医生矩阵都使用来自九种验证集的180张图像进行计算。CNN矩阵是使用来自验证集的684张图像(平均分布在9个类中)的随机样本计算的。gydF4y2Ba

图3来自第二种验证策略的9个示例图像的显著性映射。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2Ba我gydF4y2Ba例如,第二种验证策略的9种临床疾病类别中的每一种的显著性图揭示了对CNN预测影响最大的像素。显著性图显示了相对于CNN损失函数的像素梯度。深色像素代表影响力更大。我们看到病变本身和显著图之间有明显的相关性。有单一病变的情况(gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2BafgydF4y2Ba)倾向于以病灶为中心显示紧密的显著图。病变扩散的情况(gydF4y2BaggydF4y2Ba- - - - - -gydF4y2Ba我gydF4y2Ba)展示了显著图,它们同样占据了图像中的多个兴趣点。gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba,恶性黑素细胞病变(来源图片:gydF4y2Bahttps://www.dermquest.com/imagelibrary/large/020114HB.JPGgydF4y2Ba).gydF4y2BabgydF4y2Ba,恶性表皮病变(来源图片:gydF4y2Bahttps://www.dermquest.com/imagelibrary/large/001883HB.JPGgydF4y2Ba).gydF4y2BacgydF4y2Ba,恶性皮肤病变(来源图片:gydF4y2Bahttps://www.dermquest.com/imagelibrary/large/019328HB.JPGgydF4y2Ba).gydF4y2BadgydF4y2Ba良性黑素细胞病变(来源图片:gydF4y2Bahttps://www.dermquest.com/imagelibrary/large/010137HB.JPGgydF4y2Ba).gydF4y2BaegydF4y2Ba,良性表皮病变(来源图片:gydF4y2Bahttps://www.dermquest.com/imagelibrary/large/046347HB.JPGgydF4y2Ba).gydF4y2BafgydF4y2Ba,良性真皮病变(来源图片:gydF4y2Bahttps://www.dermquest.com/imagelibrary/large/021553HB.JPGgydF4y2Ba).gydF4y2BaggydF4y2Ba,炎症情况(来源图片:gydF4y2Bahttps://www.dermquest.com/imagelibrary/large/030028HB.JPGgydF4y2Ba).gydF4y2BahgydF4y2Ba,基因性皮肤病(图片来源:gydF4y2Bahttps://www.dermquest.com/imagelibrary/large/030705VB.JPGgydF4y2Ba).gydF4y2Ba我gydF4y2Ba皮肤淋巴瘤(来源图片:gydF4y2Bahttps://www.dermquest.com/imagelibrary/large/030540VB.JPGgydF4y2Ba).gydF4y2Ba

图4扩展数据gydF4y2Ba图3gydF4y2Ba有一个不同的皮肤病问题。gydF4y2Ba

一个gydF4y2Ba,相同的图和结果如图gydF4y2Ba图3gydF4y2Ba除了皮肤科医生被问及病变是恶性还是良性。这是一个有点不自然的问题,在临床中,唯一可行的决定是是否活检或治疗病变。CNN的蓝色曲线与gydF4y2Ba图3gydF4y2Ba.gydF4y2BabgydF4y2Ba,gydF4y2Ba图3 bgydF4y2Ba转载的视觉对比gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

表1疾病分区算法gydF4y2Ba
表2一般验证结果gydF4y2Ba

幻灯片gydF4y2Ba

权利与权限gydF4y2Ba

转载及权限gydF4y2Ba

关于本文gydF4y2Ba

通过CrossMark验证货币和真实性gydF4y2Ba

引用本文gydF4y2Ba

埃斯特娃,A.,库普瑞尔,B.,诺沃亚,R.。gydF4y2Baet al。gydF4y2Ba用深度神经网络对皮肤癌进行皮肤科医生级别的分类。gydF4y2Ba自然gydF4y2Ba542年,gydF4y2Ba115 - 118(2017)。https://doi.org/10.1038/nature21056gydF4y2Ba

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