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基因本体论:生物学的统一的工具

基因组测序已明确表示,大部分的基因指定核心生物功能共享的所有真核生物。知识共享蛋白质这样的生物作用在一个生物通常可以转移到其他生物。基因本体论联盟的目标是产生一个动态的,受控词汇表,可以应用于所有真核生物,即使基因在细胞和蛋白质的作用是累积的知识和变化。为此,三个独立的本体可以在全球网络(http://www.geneontology.org)被构造:生物过程,分子功能和细胞成分。

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图1:基因本体论的例子。
图2:分层聚类之间的对应表达微阵列实验的条件。

引用

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确认

我们感谢k . Fasman和m . Rebhan有用的讨论,和阿斯特拉捷利康对金融支持。P41 SGD支持,国家资源,由国家人类基因组研究所(NHGRI)授予HG01315;MGD的P41 NHGRI格兰特HG00330;GXD由国家儿童健康和人类发展研究所的格兰特HD33745;和果蝇P41 NHGRI格兰特HG00739和英国医学研究理事会,伦敦。

作者信息

作者指出

  1. 果蝇库(http://www.flybase.bio.indiana.edu)。

    • 伯克利果蝇基因组计划(http://fruitfly.bdgp.berkeley.edu)。

      • 酿酒基因组数据库(http://genome-www.stanford.edu)。

        • 老鼠基因组数据库和基因表达数据库(http://www.informatics.jax.org)。

          • *基因本体财团

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            ashburn, M。球,C。,Blake, J.et al。基因本体论:生物学的统一的工具。Nat麝猫25日,25 - 29 (2000)。https://doi.org/10.1038/75556

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