TY -的T1 -使用全基因组sequencing-based方法检测结核分支杆菌< em > < / em >监测在欧洲在2017 - 2019年:一个ECDC试点研究JF -欧洲呼吸杂志》乔和J - 10.1183/13993003.02272 -2020欧元六世- 57 - 1 SP - 2002272 AU - Elisa Tagliani AU -理查德·安东尼AU -托马斯·a·科尔AU -阿尔伯特·德·奈尔非盟-弗拉德Nikolayevskyy盟Csaba Kodmon AU -弗洛里安·p·毛雷尔盟Stefan Niemann盟迪克·范·Soolingen AU - Marieke J·范德Werf盟Daniela玛丽亚Cirillo Y1 - 2021/01/01 UR - //www.qdcxjkg.com/content/57/1/2002272.abstract N2 -全基因组测序(WGS)可用于结核分枝杆菌的分子类型和描述复杂(MTBC)菌株。我们评估系统使用WGS-based MTBC监测方法包括所有欧盟/欧洲经济区(欧盟/ EEA)国家和突出的挑战和经验教训,被认为是未来发展的WGS-based监视系统。WGS和流行病学数据的患者rifampicin-resistant (RR)和耐多药结核病(MDR) (TB)从欧盟/欧洲经济区国家收集2017年1月至2019年12月。WGS-based遗传相似度分析使用一个标准化的方法包括茎核心基因组序列输入(cgMLST)和单核苷酸多态性(SNP)的计算距离在所有WGS数据满足最低质量标准,以确保数据的可比性。总共有2218 RR / MDR-MTBC隔离收集了来自25个国家。其中,56个跨境集群与最近的可能性增加传输距离(≤5个snp)由316 RR / MDR-MTBC隔离标识。跨境集群包括两个和30耐药隔离两到六个国家,展示不同的RR /耐多药结核病传播模式在西方和东方的欧盟国家。这一初步研究表明WGS-based监测系统不仅可行,而且可以有效地阐明国内和跨境RR /耐多药结核病传播的动力学在欧盟/欧洲经济区国家。教训这个研究强调建立一个欧盟/欧洲经济区国家中央集权WGS-based结核病需要加强国家监测系统集成系统进行前瞻性WGS监测和清晰的发展过程来促进国际合作调查的跨境集群。WGS-based监测系统监测的实现耐多药结核病疫情的出现在欧洲是可行的和有可能提供证据,以更好地阐明跨境传播模式https://bit。ly / 2 ztnpjk ER -