@article {Tagliani2002272作者= {Elisa Tagliani和理查德·安东尼和托马斯·a·科尔和阿尔伯特·德·奈尔和弗拉德Nikolayevskyy Csaba K {\“o} dm {\ " o} n和Florian p·毛雷尔Stefan Niemann和迪克·范·Soolingen Marieke j . van der Werf和丹妮拉玛丽亚Cirillo} ={编辑和Augustynowicz-Kope {\ ' c}, Ewa Bachiyska, Elizabeta bako,艾格尼丝和Coriu罗克珊娜和Dvo {\ v r} {\ '} kov {\ ' v}, {} \ v e ra和Fattorini, Lanfranco和菲茨吉本,玛格丽特和G {\ l} ogowska,阿格涅斯卡和Groenheit,雷蒙娜和Haanper {\”}, Marjo Le {\ ' o} n,劳拉Herrera Homorodean,达妮埃拉和因陀罗,亚历山大和杰克逊,莎拉和Kummik Tiina Lillebaek,他和马赛,丽塔和数学,凡妮莎和Mengshoel,安妮Torunn默克,马提亚,Nadarajan Darshaalini诺曼,安德斯和钢管,Ilva Porvaznik,伊戈尔和Sougakoff Wladimir Spitaleri,安德里亚和Truden,莎拉和Vasiliauskaite Laima和{\ v Z} mak Ljiljana}, title ={使用全基因组sequencing-based结核分枝杆菌监测方法在欧洲2017年{\ textendash} 2019:一个ECDC试点研究},体积= {57}= {1},elocation-id = {2002272} = {2021}, doi ={10.1183/13993003.02272 -2020},出版商={欧洲呼吸学会},文摘={全基因组测序(WGS)可用于结核分枝杆菌的分子类型和描述复杂(MTBC)菌株。188bet官网地址我们评估系统使用WGS-based MTBC监测方法包括所有欧盟/欧洲经济区(欧盟/ EEA)国家和突出的挑战和经验教训,被认为是未来发展的WGS-based监视系统。WGS和流行病学数据的患者rifampicin-resistant (RR)和耐多药结核病(MDR) (TB)从欧盟/欧洲经济区国家收集2017年1月至2019年12月。WGS-based遗传相似度分析使用一个标准化的方法包括茎核心基因组序列输入(cgMLST)和单核苷酸多态性(SNP)的计算距离在所有WGS数据满足最低质量标准,以确保数据的可比性。总共有2218 RR / MDR-MTBC隔离收集了来自25个国家。其中,56个跨境集群与最近的可能性增加传输距离(< = 5个snp)由316 RR / MDR-MTBC隔离标识。跨境集群包括两个和30耐药隔离两到六个国家,展示不同的RR /耐多药结核病传播模式在西方和东方的欧盟国家。这一初步研究表明WGS-based监测系统不仅可行,而且可以有效地阐明国内和跨境RR /耐多药结核病传播的动力学在欧盟/欧洲经济区国家。教训这个研究强调建立一个欧盟/欧洲经济区国家中央集权WGS-based结核病需要加强国家监测系统集成系统进行前瞻性WGS监测和清晰的发展过程来促进国际合作调查的跨境集群。WGS-based监测系统监测的实现耐多药结核病疫情的出现在欧洲是可行的和有可能提供证据,以更好地阐明跨境传播模式https://bit。ly / 2 ztnpjk}, issn = {0903 - 1936}, URL = {//www.qdcxjkg.com/content/57/1/2002272}, eprint = {//www.qdcxjkg.com/content/57/1/2002272.full.pdf},杂志={欧洲呼吸杂志}}