TY-JOUR T1-全基因组测序的准确性以确定最近的结核病传播：德国汉堡的一项为期11年的基于人群的研究JF-欧洲呼吸杂志JO-Eur Respir J DO-10.1183/13993003.01154-2019 VL-54 IS-5 SP-1901154 AU-Diel，罗兰AU-Kohl，托马斯A.AU-Maurer，弗洛里安P.AU-Merker，马蒂亚斯•奥-梅瓦尔德•沃尔特、卡伦•奥-汉尼曼、约尔格•奥-尼豪斯、阿尔伯特•奥-供应、菲利普•奥-尼曼、斯特凡Y1-2019/11/01 UR-//www.qdcxjkg.com/content/54/5/1901154.abstract N2-控制人与人之间的结核病（TB）传播是实现世界卫生组织（WHO）制定的最终结核病战略目标的关键[1,2]。阻止结核病传播，特别是在大城市，是全世界最具挑战性的优先事项[3]。大都市地区的结核病病例通知率高于国家其他地区，因为它们集中了高风险群体，如无家可归者、吸毒者和经常来自（其他）高结核病发病率地区的移民。人口密度和复杂的社会互动放大了传播机会，定期导致大规模、临时扩展的传播网络[3]。中断传播的有针对性的干预措施需要有效的结核菌株基因分型与加强流行病学调查相结合。虽然经典的IS6110 DNA指纹和24位点MIRU–VNTR（分枝杆菌散布重复单元–可变串联重复数）分型通过在线命名系统提供标准化且易于计算的分型结果，但一些研究现已证明全基因组测序（WGS）具有优越的鉴别能力，可以无与伦比地解决爆发菌株[4-10]。然而，相对于最确定的参考，即通过特别调查确定的有形流行病学联系，WGS在大都市地区检测传播的预测性尚未量化，在延长的时间和人群范围内。使用五个SNP c:d:ut off的WGS分型以最高的准确性描绘了最近的传播链，还提供了高分辨率的耐药模式，从而实现了直接的临床效益http://bit.ly/2Pk37WoWe 我要感谢伊尔塞·拉迪齐奥、瓦妮莎·莫尔、坦贾·尼曼和朱莉娅·扎勒特（全部来自德国Borstel研究中心），德国汉堡市中心公共卫生部的工作人员以及卡罗琳·阿利克斯·贝盖克、西里尔·高丁、玛蒂尔德·梅里和斯特芬尼·杜托伊（法国里尔全基因组筛查）在基因组测序方面提供了技术援助-