TY - JOUR T1 -全基因组测序确定近期结核病传播的准确性:11年以人群为基础的研究在德国汉堡JF -欧洲呼吸杂志》乔和J - 10.1183/13993003.01154 -2019欧元六世- 54 - 5 SP - 1901154盟一昼夜的罗兰AU -科尔,Thomas a . AU -毛雷尔,Florian p . AU -默克,马提亚AU - Meywald沃尔特,凯伦盟——Hannemann Jorg盟——Nienhaus艾伯特AU -供应,Philip AU - Niemann, Stefan Y1 - 2019/11/01 UR - //www.qdcxjkg.com/content/54/5/1901154.abstract N2 -控制人-人结核病(TB)传播是实现世界卫生组织(世卫组织)制定的终结结核病战略目标的关键[1,2]。阻止结核病传播，特别是在大城市，是世界范围内最具挑战性的首要任务。大都市地区的结核病病例通报率高于该国其他地区，因为这些地区集中了无家可归者、吸毒者和往往来自(其他)结核病高发病率环境的移民等高危人群。人口密度和复杂的社会互动放大了传播的机会，经常导致大规模的、暂时扩展的传播网络[3]。阻断传播的有针对性的干预措施需要结合有效的结核菌株基因分型和加强流行病学调查。虽然经典的IS6110 DNA指纹和24位点MIRU-VNTR(分枝杆菌分散重复单位-串联重复重复可变数量)分型提供了标准化和易于计算的在线命名系统的分型结果，几项研究现已证明，全基因组测序(WGS)具有优越的鉴别能力，能够对暴发菌株进行无与伦比的分辨[4-10]。然而，与大多数确定性参考(即通过特别调查确定的具体流行病学联系)相比，在较长时间和人口规模下，WGS检测大都市地区传播的预测能力尚未得到量化。WGS typing with a five-SNP c:d:ut-off delineates recent transmission chains with highest accuracy and also provides high-resolution resistance patterns, thus enabling direct clinical benefits http://bit.ly/2Pk37WoWe would like to thank Ilse Radizio, Vanessa Mohr, Tanja Niemann and Julia Zallet (all from Research Center Borstel, Germany), for technical assistance, the staff of the Public Health Department Hamburg-Central, Germany and Caroline Allix-Béguec, Cyril Gaudin, Mathilde Mairey and Stéphanie Duthoy (all Genoscreen, Lille, France) for their help in genome sequencing. ER -